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新型技术绘制基因图谱 有望改善癌症诊断

转载 来源: 生物谷 2017/7/5 11:49:23

基因组结构的大规模改变通常在癌细胞中比较常见,近日来自英国巴布拉汉研究所(Babraham Institute)的研究人员通过研究就发现了一种能够检测这些改变的新方法,相关研究刊登于国际杂志Genome Biology上,该研究或为后期研究人员开发增强癌症诊断的新方法及癌症新型靶向疗法提供新的思路和希望。

这篇研究报告中,研究者描述了一种名为Hi-C技术的新应用,这种技术能够帮助研究人员绘制出遗传物质在细胞内部的排列方式和机制,通过对相关信息进行分析,研究人员就能够可靠地鉴别出其它方法可能会错过的一些主要的遗传改变,相比标准的DNA测序方法而言,这种方法的成本较低。

Hi-C能够对染色体的重排进行检测,染色体重排,即大片段DNA发生交换或者在染色体的片段间移动;同时这种技术还能够对拷贝数变异进行检测,即遗传物质的拷贝或剔除情况,所有这些改变都会对细胞的行为产生剧烈的影响。研究者Louise Harewood博士表示,在一般人群和大部分癌症患者中我们都能够看到染色体的重排现象,对患者机体的染色体重排进行检测往往非常麻烦,而且有时候很容易错过,当然这或许是非常不利的,尤其是在肿瘤学领域中,因为染色体重排往往扮演着诊断和患者预后的角色。

研究者Peter Fraser教授指出,这项研究中,我们对6名脑瘤患者的肿瘤组织进行分析,利用Hi-C技术对癌细胞的基因组进行了检测,最终鉴别出了主要的基因组改变;未来这种方法或许就能够帮助医生和科学家们在全基因组的广泛背景下研究遗传改变,Hi-C技术也将会成为一种强有力的工具帮助理解多种癌症中复杂的遗传改变。

最后,研究者表示,Hi-C技术在检测染色体异常上扮演着关键角色,而且其还能够帮助发现基因组中的新型融合基因,相比当前技术而言,该技术还能够对质量较低的样本进行检测,同时也能够通过相同的数据提供拷贝相同的信息,相比当前使用的DNA测序标准方法而言,这种新技术的成本将会大大降低。

(责编:张晓萌 )

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相关问答
Q:病毒癌基因与原癌基因的关系和区别是否适合服用参一胶囊

癌基因(proto-oncogene)本身是管理细胞分裂周期的基因,一般都是Cdk家族或者一些信号的受体家族,比如说是EGF(表皮生长因子)。当他们发生突变,或者是转录失去控制,就会使细胞分裂加速,导致癌症。 病毒癌基因,因为病毒需要细胞复制,来提供其所需要的复制条件(细胞器,结构分子),所以,有些病毒携带的基因结构和功能上类似于细胞内对细胞周期进行调控的分子,因为病毒分裂快,所以细胞很快就会在病毒癌基因的刺激下分裂,继而发生突变,失去控制。有些逆转录病毒,将其自身的基因组插入宿主的基因组,因为病毒基因启动子的高效性,当处于原癌基因附近时,就会造成原癌基因过度表达。但是,由于插入位置不确定,所以将宿主细胞转变成癌细胞的可能性很小,也比较慢。这和上一种情况有区别,但是,这种病毒基因,不叫病毒癌基因。 不同的癌症类型需要医生的处方才可以服用参一胶囊,参一胶囊的药理机制是抑制肿瘤血管上皮细胞的生成,对抑制肿瘤复发和转移有显著疗效。

Q:遗传基因检测

通过使用基因芯片分析人类基因组,可找出致病的遗传基因。癌症、糖尿病等,都是遗传基因缺陷引起的疾病。医学和生物学研究人员将能在数秒钟内鉴定出最终会导致癌症等的突变基因。借助一小滴测试液,医生们能预测药物对病人的功效,可诊断出药物在治疗过程中的不良反应,还能当场鉴别出病人受到了何种细菌、病毒或其他微生物的感染。

Q:诺瓦克病毒性胃肠炎征的病因是什么

您好,发病原因:诺瓦克病毒呈球形,直径27nm左右。无包膜,为单股正链RNA,在宿主细胞核中复制。其基因组包括3个开放读码框架,ORF1编码具有RNA多聚酶性质的非结构蛋白前体,ORF2编码一种相对分子量约为57kD的衣壳蛋白。此蛋白有抗原性,也能产生抗体。ORF3编码一种分子量约22.5kD的蛋白质,其作用尚不清楚。目前,诺瓦克病毒和诺瓦克样病毒没有系统的分类和命名,诺瓦克病毒为这类病毒最具有代表性的一种。开始归类于小圆结构病毒,因为颗粒直径均为30nm左右,而且彼此形态上不能区分,临床情况相似。但是目前众多学者的研究表明,该病毒在基因组结构、编码蛋白及病毒的形态结构上都与杯状病毒最相似,故在病毒分类上已经归于杯状病毒科。目前,根据RNA多聚酶区的核苷酸序列或其所编码氨基酸序列的相似性,将诺瓦克样病毒至少分为3个基因组,各组代表株分别为NV、SMA和Sapporo组分。其中SMA基因组可分为两个亚组,SMA和HWA为一亚组,另一亚组包括MXV、Minireovirus、Oth-25和Bristol virus。3个基因组中的Sapporo组在形态上更似杯状病毒,在核苷酸序列上也更接近于动物杯状病毒,而与其他两组病毒相似性低。诺瓦克样病毒的分型还有待于进一步研究。该病毒耐酸、耐乙醚,对热稳定,60℃ 30min不能完全灭活,在pH 2.7的环境中可存活3h,在氮化铯中的浮力密度为1.36~1.41g/cm3。

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