舟曲县治疗艾滋病的医院可以到卫生行政部门指定具备条件的医院。在不具备提供相关医疗服务诊疗条件时，医疗机构要及时将艾滋病患者和病毒感染者转诊至定点医院，或向舟曲县当地卫生行政部门报告，由卫生行政部门协调转诊等相关事宜；不适宜转诊的艾滋病患者和病毒感染者，由卫生行政部门组织定点医院相关医务人员到接收医疗机构开展医疗服务工作。艾滋病是由人体的免疫系统被艾滋病病毒破坏，使人体对威胁生命的各种病原体丧失了抵抗能力，从而发生多种感染或肿瘤，最后导致死亡的一种严重传染病。高效抗逆转录病毒治疗是艾滋病的最根本的治疗方法。而且需要终生服药。常用药有核苷类反转录酶抑制剂、非核苷类反转录酶抑制剂、蛋白酶抑制剂、整合酶抑制剂、融合酶抑制剂及CCR5抑制剂。推荐我国成人及青少年的方案：齐多夫定/替诺福韦+拉米夫定+依非韦伦/奈韦拉平。

舟曲县接种百日咳疫苗可以到舟曲县当地街道社区医院，舟曲县所属村镇的卫生所。百日咳是由百日咳杆菌引起的儿童急性呼吸道传染病。目前使用白喉、百日咳和破伤风三联制剂(DTP菌苗)在生后3个月、4个月、5个月各接种1次，每次0.5ml(含百日咳4个保护单位)。若百日咳流行时，可提前至生后1个月，但出生时有外伤史、过敏史，家族中有精神、神经病史和存在急性感染时不宜作菌苗注射。

舟曲县治疗肺气肿的医院可以到舟曲县人民医院，舟曲县中医院挂号就诊，如果舟曲县当地医院没有设备或是资质进行治疗的，可以到最近的三甲医院，肺病研究所，医学院校的附属医院等大医院就诊。据世界卫生组织估计，肺气肿仅次于心血管疾病、脑血管疾病和急性呼吸道感染，与艾滋病并列为全球第四大死亡原因。对阻塞性肺气肿的治疗以往多数依靠氧疗、呼吸功能锻炼以及控制感染等非手术治疗方法，近年随着对该病研究的深入，肺气肿的手术治疗外科干预对恢复肺功能有较好的帮助。