2012年，合肥市将在公立医院改革中实现公私互补、错位发展的目标，提高医疗资源的利用率，避免重复建设造成的浪费。同时，将进一步打造基层医改“合肥样本”特色，提升基层乡镇卫生院的医疗服务能力。
据统计，去年全国孕产妇死亡率为0.026%。5岁以下儿童的死亡率对人均期望寿命的贡献率是68%。因此，有效的控制好5岁以下儿童的死亡率对提高人均期望寿命具有十分重要的意义。今年，合肥市将高度关注妇女儿童健康，提高妇幼保健服务能力和水平，将孕产妇死亡率控制在0.012%。
在十二五规划中，合肥市提出实现人均期望寿命提高1.5岁，城市孕产妇保健系统管理率达到90%，农村达到80%;城市孕产妇住院分娩率达到99%，农村达到90%；城市7岁以下儿童保健管理率达到90%，农村达到96%。
今年是全面消灭麻疹之年，合肥市将以县区为单位，将麻疹的发病率控制在0.0001%，这一目标作为硬性指标将被纳入考核，并实行一票否决。
在食品药品安全监管上，合肥市将重点加强食品生产、流通，生猪屠宰、保健食品和餐饮服务行业监管力度，严厉打击各类食品安全违法行为，以及食品非法添加和滥用食品添加剂行为，确保人民群众的食品安全。加强保健食品和化妆品质量监管，对重点地区、重点产品和重点品种开展多层次有针对性的监管。
其次，严密监测中标价格异常偏低的基本药物质量，建立基本药物的药品监测、不良反应监测和生产现场监测检查的联动机制，所有基本药物配送企业从今年4月1日起全面落实附码品种核注核销，并实行网上数据传输。
再者，重点加强对高风险基本药物中药生产企业的监管，强化对特色药品的监管，进一步实施振兴皖药行动计划，推动合肥医药工业经济的健康发展；加强对疫苗、冷藏药品、终止妊娠药品、含特殊药品复方制剂等重点品种的监管，并对药品批发企业实施信用等级管理，确保人民群众的用药安全。
