自1981年正式从福建迁入广州，到1994年被评定为全国首批三级甲等医院，珠江医院用十余年时间完成了华丽蜕变。
“九五”时期（1995年-2000年），院党委带领全院同志解放思想，抓住机遇，深化改革，勇于创新，强化管理，实现了医院“高起点、大跨度、超常规”的发展战略，学科人才建设发展迅速，医教研业务水平快速攀升，基础设施条件显著改善，医院综合实力明显增强。
1999年11月，原中央军委委员、总后勤部部长王克视察珠江医院，高度评价医院起步晚、发展快、潜力大。
学科建设上台阶
院党委坚持把学科人才作为医院建设和发展的重中之重，确定了学科人才建设的总体思路和奋斗目标，明确了阶段目标，促进了学科快速发展。按照“院有重点、科有特色、人有专长”的建设思路，医院大力加强优势学科建设，形成了多专业、多领域的优势学科群。科室从38个增加到50个，拥有全军医学中心5个，广东省医学中心1个及广东省“五个一科教兴医工程”3个重点专科。
全军神经医学中心
集神经内科、神经外科、神经生物医学研究所三位一体，具有基础与临床结合、内外科结合、中西医结合、医教研结合的特点。
全军骨科中心
为广东省“五个一科教兴医工程”重点专科。在国际上首次阐明了腰背痛的原发部位与神经根的关系，并提出了治疗新观点。
全军儿科中心
被命名为全军优生优育技术中心和广东省新生儿医学中心，在国内首创危重小儿转运网络，新生儿重症监护治疗技术达到国内先进水平。
全军神经医学中心
集神经内科、神经外科、神经生物医学研究所三位一体，具有基础与临床结合、内外科结合、中西医结合、医教研结合的特点。
全军骨科中心
为广东省“五个一科教兴医工程”重点专科。在国际上首次阐明了腰背痛的原发部位与神经根的关系，并提出了治疗新观点。
全军儿科中心
被命名为全军优生优育技术中心和广东省新生儿医学中心，在国内首创危重小儿转运网络，新生儿重症监护治疗技术达到国内先进水平。
为军为民优服务
“九五”期间，医院主动适应医学模式转变和国家及军队卫生体制改革的需要，坚持以病人为中心，以优质服务为核心，以规范化管理为重点，加强医疗技术特色和医德医风建设，积极开展争创“百佳”医院和姓“军”为兵医疗活动，医疗服务水平明显提高，社会效益显著增强。
医院1997年被评为爱婴医院，2000年被国家卫生部确定为“国际紧急救援中心网络医院”。
姓“军”为兵服务
1996年-2000年期间，医院先后派出各个学科专家赴新疆15、16医院、二炮535医院等单位进行技术帮带；选派医务人员到嫩江基地、襄樊370医院等基层部队医院代职；组织医疗队赴广州海军基地、海军沙角基地、汕头水警区、广州军区124师等单位为官兵看病查体；为战区部队医院会诊、讲学和手术示范，培训医疗骨干；为海岛官兵捐赠药品等。
涉外医疗服务
1994年，医院创办谊侨科，新建设施现代化、服务功能齐全、居住环境舒适的宾馆式综合病房大楼，为海内外广大患者服务。谊侨科拥有宾馆式套房72间，床位144张，长期以来，凭借良好的信誉、精湛的医术、高尚的医德、优质的服务、廉洁的医风医德享誉海内外。
深化改革强师资
珠江医院一直以来，坚持军医大学附属医院的教学职能，积极深化教学改革，加强师资队伍建设，努力改善教学条件，不断强化教学管理，圆满地完成了各专业层次的教学任务。
1988年，医院以优异成绩通过了总后勤部临床教学基地评估检查；2000年，医院首次承担了军事医学综合演练野战外科教学。
“九五”期间，医院共完成2049名学员的临床教学任务，培养军内外进修生1232名，10名研究生被评为“南粤优秀研究生”，1名博士研究生在巴黎第七届国际抗癌治疗大会上获“青年研究者奖”。
科研形成新格局
珠江医院坚持不懈实施“科技兴院”的发展战略，形成了以军事医学和预防医学为重点，以重点学科、重点实验室为依托，全面部署、整体推进、重点突破的科研格局，医院科技整体实力明显增强。
“九五”期间，全院承担各类课题基金从数量到质量均有大幅度的提高，省级以上基金从“八五”末的51项增加到111项，资助金额从149万元增加到1100万元。
其中，国家自然科学基金、军队重点课题、省重点攻关项目、省自然科学基金等高水平课题数从“八五”前的12项增加到77项，增长了6.4倍。
“九五”期间，医院共完成2049名学员的临床教学任务
全军儿科中心---珠江医院儿科在国内首创危重小儿陆空立体转运网络
邵振海教授首创经皮穿刺低温冷冻脊神经后支治疗腰腿痛疗效显著
医院1994年创办谊侨科
医院组织医疗队为官兵看病查体
原中央军委委员、后勤部部长王克视察珠江医院并给予高度评价
