氯被广泛用于确保饮用水安全，但其对婴儿肠道微生物组的影响尚未被充分了解。在本研究中，我们进行了一项临床试验，让6至18个月大的婴儿饮用标准氯化水或通过桌面过滤去除氯的过滤水。我们通过粪便样本分析了他们的肠道微生物组。总体而言，两组之间的肠道微生物多样性和整体结构相似。然而，饮用氯化水的婴儿显示出与抗生素抗性相关的基因水平更高。这些发现表明，虽然氯化对安全饮水仍然至关重要，但它可能会影响生命早期的微生物功能，这可能对长期健康产生影响。
水质与微生物组研究(TUMS)是一项基于澳大利亚的双盲随机对照试验。197名六个月大的婴儿(99名接受去氯饮用水处理组，98名接受常规氯化水对照组)在12个月内分别饮用不同处理的水。在干预开始和结束时收集自来水和粪便样本，使用宏基因组测序进行粪便微生物组分析。主要研究结果是两组间肠道微生物群的差异，次要结果包括过敏致敏和呼吸道疾病的发生率。
在基线时，共收集了170份粪便样本(83份对照组，87份干预组)，在干预结束时获得130份样本(65份对照组，65份干预组)。干预后，两组之间的整体群落结构相似，包括β多样性(解释方差0.56%；p=0.84)、丰富度(-4.25，95%置信区间：-14.85至6.35，p=0.43)或香农指数(-0.14，95%置信区间：-0.32至0.04，p=0.12)。氯化水组显示出抗生素抗性MetaCyc组和通路的富集(调整后p<0.05)。分层分析表明，这一效应在临床使用抗生素的情况下更为显著。
氯化饮用水可能会增强婴儿肠道微生物组中的抗药性功能。虽然氯化处理对公共卫生仍然至关重要，但未来研究应探索是否可以通过调整饮用水消毒剂引入婴儿饮食的时间或方法来减少选择压力。
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