摘要
背景
现代基因分型平台使复杂疾病的遗传成分系统性搜索成为可能。本研究对两项冠心病全基因组关联研究进行了联合分析。
方法
我们首先在惠康信托病例对照联盟(WTCCC)研究中(包含1926名冠心病患者和2938名对照)识别出与冠心病强相关的染色体位点,并在德国心肌梗死家族研究(包含875名心肌梗死患者和1644名对照)中进行验证。随后整合两项研究中其他与冠心病显著相关(P<0.001)的单核苷酸多态性(SNPs)数据,以识别具有高真实关联概率的额外位点。两项研究的基因分型均采用Affymetrix GeneChip人类基因组图谱500K阵列套装完成。
结果
在研究的数千个染色体位点中,染色体9p21.3(SNP,rs1333049)在WTCCC和德国研究中均显示最强关联(P值分别为1.80×10^-14和3.40×10^-6)。WTCCC研究共发现九个与冠心病强相关的位点(P<1.2×10^-5且假阳性概率低于50%)。除9p21.3外,染色体6q25.1(rs6922269)和2q36.3(rs2943634)在德国研究中成功验证(校正P<0.05)。两项研究的整合分析进一步确认四个新位点与冠心病显著相关(P<1.3×10^-6)且真实关联概率超过80%:染色体1p13.3(rs599839)、1q41(rs17465637)、10q11.21(rs501120)和15q22.33(rs17228212)。
结论
本研究鉴定出多个遗传位点,这些位点单独或共同作用显著影响冠心病发病风险,为理解冠心病的遗传机制提供了关键科学证据。
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