Graph former-CL:一种结合对比学习框架的新型图变换器,用于增强药物-药物相互作用预测
该研究提出了一种名为Graph Former-CL的新型深度学习框架,用于药物-药物相互作用(DDI)预测。该框架创新性地融合了图变换器架构与对比学习,通过位置感知的多头自注意力机制捕获局部和全局分子模式,并引入域特定对比学习模块、跨模态融合机制以及自适应池化策略。在四个基准数据集上的全面评估表明,Graph Former-CL在DrugBank上达到98.2%的准确率,在TWOSIDES上达到89.4%,均显著优于现有方法(p<0.001)。尤其在归纳设置下,框架对新药预测准确率达85.6%,展现了强大的泛化能力,对临床实际应用具有重要意义。该研究还通过注意力可视化、分子子结构分析和案例研究验证了模型的可解释性和临床相关性,为药物安全评估和临床决策支持提供了有力工具。

