Laura Bukavina博士在2025年美国临床肿瘤学会泌尿生殖系统癌症研讨会（ASCO GU）上介绍了题为“尿液微生物组的基因组规模代谢重建：个性化医疗的途径”的研究报告。Bukavina博士是俄亥俄州克利夫兰诊所的泌尿肿瘤学助理教授和转化科学负责人。
研究背景及原理
我们对微生物组的理解已经有所发展。最初的研究主要集中在特征描述，即查看尿液或组织中是否存在特定细菌，这些细菌可能与膀胱癌的发生有关。现在，我们正在从这一角度转向代谢组学，探讨尿液和组织中的微生物是如何代谢我们给予患者的药物的，特别是化疗药物如吉西他滨。
人们往往不把BCG视为细菌，但它确实是一种巨大的微生物群，它通过引发尿路感染来治疗癌症。在这个过程中，患者的微生物组可能会干扰BCG的效果，也可能影响其他药物，包括化疗药物吉西他滨。已有研究表明，细菌可以利用吉西他滨作为食物，将其分解为活性较低的代谢物。因此，我们的目标是基于患者的尿液样本，计算其中存在的细菌对吉西他滨的代谢能力。长期目标是为患者提供所谓的精准微生物检测，帮助他们调整微生物组，使其不分解吉西他滨，从而改善化疗效果。
关键发现
这项研究类似于可行性研究。我们从RETAIN试验中选取了患者样本。RETAIN试验是由福克斯蔡斯癌症中心进行的一项保留膀胱的协议。我们收集了这些患者的尿液样本，测试其对吉西他滨代谢能力的预测准确性。结果显示，我们能够较为准确地预测其代谢能力。
下一步是验证我们是否具备完整的计算网络，是否能结合全基因组测序，不仅考虑微小残留病的标准，还能提取微生物组数据，预测哪些细菌会分解化疗药物。我们在这一阶段取得了成功。接下来，我们将前瞻性地收集接受吉西他滨或吉西他滨/多西他赛治疗的患者的尿液样本，并在我们自己的患者队列中验证这些结果，同时将其与患者的反应数据联系起来。
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