非抗生素药物同样会改变微生物组——有时会产生令人意外的影响。发表在《自然》杂志上的新研究表明，某些治疗感染的抗生素会杀死人体内有益菌群，导致微生物组（包括细菌和真菌在内的所有微生物）丧失定植抗性，即有益微生物抑制有害微生物定殖的能力。
越来越多的证据表明，非抗生素药物也会扰乱微生物组。然而，哪些扰动容易被人体耐受，哪些又会增加健康并发症风险仍不明确。耶鲁大学医学院的研究人员通过蒙特利尔百万人口医疗数据筛选出多种与胃肠道感染风险上升相关的非处方药物，并在小鼠模型中验证了21种药物对肠道菌群的影响。其中地高辛（治疗充血性心力衰竭）、氯硝西泮（抗癫痫和焦虑药物）、泮托拉唑（胃酸抑制剂）和喹硫平（抗精神病药）四种药物显著降低宿主抗感染能力。
研究团队发现地高辛的作用机制特别值得注意：该药物并不直接作用于微生物，而是激活宿主小肠上皮细胞释放抗菌蛋白。这些蛋白会选择性清除特定微生物——虽然只影响肠道数百种菌群中的少数种类，但这些菌群恰好负责维持免疫系统"警戒状态"。当这些微生物被清除后，宿主失去对沙门氏菌等病原体的防御能力，导致病原菌在肠道定殖引发感染。
研究还发现，携带人类微生物组的小鼠同样表现出相似反应。研究共同通讯作者安德鲁·古德曼教授指出："我们建立了全新的药物诱发微生物组紊乱研究框架。这些发现并非要患者停用必要药物，而是为改善药物反应和开发新型干预手段提供了理论基础。未来或许可通过调节个体微生物组来消除药物带来的感染风险。"
该研究获得美国国立卫生研究院多项资助，并得到加拿大卫生研究院支持。研究团队表示，现有流行病学队列数据即使未直接测量微生物组，仍可通过感染风险等指标追溯微生物组扰动，这为药物与微生物组相互作用研究开辟了新领域。
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