托马什·科希奥莱克博士获波兰科学基金会FIRST TEAM资助 开发全球首个肠道微生物组生成式基础模型Dr. Tomasz Kościółek wins prestigious FNP FIRST TEAM grant to develop the world’s first generative foundation model of the human gut microbiome. - Centre for Computational Personalized Medicine

环球医讯 / 硒与微生态来源:sano.science波兰 - 英语2026-01-22 02:36:37 - 阅读时长3分钟 - 1200字
波兰Sano计算医学中心宣布托马什·科希奥莱克博士成功获得波兰科学基金会FIRST TEAM项目资助,将主导开发全球首个肠道微生物组生成式基础模型microbiomeGPT。该模型基于十万余份宏基因组数据训练,可同时解析微生物群落分类与功能特征,精准识别炎症性肠病、结直肠癌及代谢疾病的生物标志物,并实现饮食干预效果预测与个性化数字孪生体构建。项目联合爱沙尼亚塔尔图大学、德国慕尼黑亥姆霍兹中心等顶尖机构,通过生成式多参数方法革新微生物组研究范式,为精准医疗和药物研发提供突破性工具,标志着人工智能在消化系统健康领域的重大应用进展。
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托马什·科希奥莱克博士获波兰科学基金会FIRST TEAM资助 开发全球首个肠道微生物组生成式基础模型

Sano计算医学中心荣幸宣布,托马什·科希奥莱克博士(Dr. Tomasz Kościółek)成功获得波兰科学基金会(FNP)FIRST TEAM项目资助。该资助将支持题为“用于数字孪生开发及生物医学应用的人类肠道微生物组生成式基础模型”(原文:“Generatywny model fundamentalny ludzkiego mikrobiomu jelitowego do tworzenia cyfrowych bliźniaków i zastosowań biomedycznych”)的研究项目。

这项开创性计划旨在构建全球首个肠道微生物组生成式基础模型,推动个性化数字孪生体在生物医学研究、疾病诊断、预防及治疗优化领域的应用。

计算生物学与个性化医学的突破

项目将开发新一代模型microbiomeGPT,该模型将基于来自不同人群及疾病状态的十万余份宏基因组数据进行训练。相较于现有微生物组分析工具,microbiomeGPT将实现以下创新:

  • 同步学习微生物群落的分类学特征与功能特性
  • 精准识别炎症性肠病、结直肠癌、糖尿病、肥胖症、帕金森病及精神健康障碍等疾病的生物标志物
  • 模拟微生物组未来状态,预测饮食、治疗或干预措施的效果
  • 生成患者数字孪生体,为精准医学和制药研发提供支持

这种生成式多参数方法有望彻底革新临床医生、研究人员及产业界对微生物组的理解与调控方式。

国际卓越合作与战略联盟

项目汇聚全球顶尖研究机构与产业伙伴:

  • 埃琳·奥格教授(Prof. Elin Org),塔尔图大学(爱沙尼亚)——提供爱沙尼亚微生物组队列数据及人群规模微生物组研究专长
  • 埃娃·什丘热克教授(Prof. Ewa Szczurek),慕尼黑亥姆霍兹中心与华沙大学——指导深度生成式人工智能模型及多组学整合
  • 波兰最大医学实验室网络Diagnostyka S.A.——支持转化测试、验证及临床应用路径开发

项目将于Sano结构与功能基因组学研究组开展,计划从2026年7月1日启动,持续至2029年12月31日。

强化健康人工智能应用

托马什·科希奥莱克博士是国际公认的生物信息学专家,专精于微生物组研究与机器学习领域。其重要贡献包括DeepFRI、Qiita等工具开发,以及在《自然》《自然·通讯》《自然·生物技术》等期刊发表的高影响力论文。

该FIRST TEAM项目将Sano推向全球AI驱动生物模型研发的前沿,契合欧洲在数字健康、精准医学及计算模拟领域的战略优先方向。

Sano创新主管K. 尼科尔森表示:

“此项目开启微生物组科学的全新篇章。我们首次能够通过生成假设场景(如同大语言模型处理文本)来建模人类肠道生态系统,而非仅限于被动观察。microbiomeGPT将使临床医生和研究人员能在现实世界发生前,预测疾病风险、模拟治疗效果并设计个性化干预方案。”

【全文结束】

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