科学研究显示，黑麦面包具有多种健康益处，包括帮助人们减肥和降低胆固醇。西班牙农业、渔业和食品部2023年食品消费报告显示，西班牙人平均每年消耗27.35公斤的面包。这一数据由网站Cope报道。西班牙营养基金会解释说，不同类型的面包提供不同的健康益处，特别是黑麦面包对健康特别有益。
黑麦面包因其低脂肪含量而突出，每100克产品仅含3.3克脂肪，这使得它适合那些希望减肥或减少热量摄入的人群。此外，其纤维含量有助于增加饱腹感和改善消化。黑麦面包还有助于消除“坏”胆固醇（即低密度脂蛋白胆固醇），从而预防心血管问题，保持动脉清洁。
黑麦面包富含磷，可以增强骨骼和牙齿，对老年人和正在成长的人来说都有益。它还含有铁、钙、硒和钠等矿物质，以及健康的脂肪酸。这些成分可以增强免疫系统并改善新陈代谢，对于素食者或纯素食者的饮食非常有益。
据西班牙消化系统基金会介绍，黑麦发酵面团允许肠道微生物调节血糖水平，以及其他好处。研究发现，食用黑麦面包后，血糖水平下降得更慢，这对健康非常有益。
健康专家表示，黑麦面包适合减肥饮食，可以每天食用，但不要过量。东芬兰大学的一项新研究表明，乳酸菌和肠道细菌共同作用，使全黑麦面包比普通面包更健康，因为其高纤维和营养含量。
用于烘焙黑麦面包的黑麦发酵面团富含乳酸菌。除了发酵面团外，这些细菌还会修改黑麦中的生物活性化合物，产生支链氨基酸和含有氨基酸的小肽，这些物质对胰岛素代谢有影响。许多黑麦中的化合物在被身体吸收之前，会被肠道细菌处理。
该研究发表在《代谢组学》杂志上，显示肠道微生物和发酵面团中的微生物产生的化合物部分相同。然而，肠道微生物还会产生三甲胺甘氨酸（也称为甜菜碱）的衍生物，这些物质存在于黑麦中。
研究发现，食用黑麦会导致血糖水平缓慢下降，带来有益的健康效果，具体原因尚不清楚。黑麦中的生物活性化合物或植物化学物质作为抗氧化剂，对健康有益。此外，肠道微生物似乎在将这些化合物转化为易于吸收的形式方面发挥重要作用，使其效果更加显著。
营养科学家蒂姆·斯佩克特教授也强调了这一点，他表示：“不要被包装上的‘高纤维’等健康标签所迷惑，这个标签的标准很低，每100克只需含有约6克纤维即可。相反，应关注碳水化合物与纤维的比例（C:F）小于5:1。我通常选择黑麦或斯佩尔特面粉的发酵面团面包，尽量多加种子。研究表明，与全麦面包相比，黑麦面包在代谢和微生物反应方面表现更好，且能让人更长时间感到饱腹。”
选择发酵面团面包可能改善面包的可消化性，一项研究发现，发酵面团面包在肠易激综合症患者中引起的症状显著较少。大多数超市的发酵面团面包添加了多种化学物质，包括商用酵母、调味料和乳化剂，以模仿真正的发酵面团的口感，缩短制作时间，因此即使标签上写有“发酵面团”，也不意味着这是更健康的产品。
研究还发现，食用黑麦导致血糖水平缓慢下降，带来有益的健康效果，具体原因尚不清楚。黑麦中的生物活性化合物或植物化学物质作为抗氧化剂，对健康有益。此外，肠道微生物似乎在将这些化合物转化为易于吸收的形式方面发挥重要作用，使其效果更加显著。
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