今日将在欧洲人类遗传学会年会上公布的一项新研究表明,癌症患者的基因祖先背景对其疾病进展和生存率有显著影响。在这项同类研究中规模最大的研究中,研究人员检查了近1,900种特定的肿瘤基因变化,以衡量某些突变在具有不同历史地理起源的患者中是否更为常见。
德克萨斯大学休斯顿健康科学中心流行病学助理教授Yixuan He博士介绍了她的研究成果,她与她的博士生Jiawei Tu合作,分析了来自两大癌症中心——达纳-法伯癌症研究所(波士顿,马萨诸塞州)和MD安德森癌症中心(休斯顿)——超过30,000名患者的基因测序数据。这些数据涵盖了五种不同的癌症:乳腺癌、结直肠癌、胶质瘤(最常见类型的脑癌)、胰腺癌和肺癌。
除了检查基因突变外,研究人员还考虑了社会经济地位和空气污染等环境因素,以确保这些因素不会扭曲研究结果。随后,他们基于基因突变创建了一个评分系统,试图预测哪些患者更有可能死于癌症,并测试了结合祖先信息是否能提高预测准确性。
尽管此前已有类似的预测评分研究,但这是首次在如此大规模上进行的同类分析。He表示:"以往的研究仅限于单一人群中的一小部分群体和单一肿瘤,而且通常没有考虑环境因素或长期临床结果。通过扩大我们的研究范围,我们希望能够展示基因祖先对癌症基因组学和临床结果的真实、可测量的影响。"
研究结果显示,根据患者的祖先背景,有数十种突变更常见或较少见,其中约一半可以通过现有治疗方法进行靶向治疗。该评分系统能够预测患者生存率,特别是在乳腺癌和胶质瘤方面。当加入祖先信息后,生存预测变得更加准确,特别是在胰腺癌方面。
在现代癌症治疗中,肿瘤测序相对常见,基因祖先也可以从这些数据中估算出来,因此整合这些信息不会增加额外成本或测试。环境因素也可以简单地根据患者居住地进行估算。He表示:"整合的挑战不在于缺乏适当的技术,而在于需要一个工作流程,能够从现有的常规数据收集中推导出这些重要因素。我们目前正在与肿瘤学家合作,希望克服这些障碍。"
研究人员现在打算扩大分析范围,包括其他癌症类型,并纳入吸烟和其他污染物等额外环境因素——理想情况下,与其他研究组合作,在其他患者队列中复制他们的发现。尽管他们的一些结论已经为人所知,但他们也能够识别出几个新的关联。例如,在非裔美国乳腺癌患者中,参与细胞增殖控制的基因(CDK6)存在过度表达(富集),而在具有混合祖先背景的美国结直肠癌患者中,另一个控制细胞增殖的基因SMAD2缺失。
He总结道:"尽管两个不同的生物样本库之间存在地理和人口差异,但我们看到一致的与祖先相关的信号被复制,这非常令人鼓舞。通过识别与祖先相关的特定基因标记,我们可以精确定位可靶向的突变,帮助医生使用能带来更好生存结果的治疗方法。通过在不同人群中验证这些信号,我们可以确保特定治疗适用于并有效于广泛的患者群体。"
会议主席、未参与此项研究的Alexandre Reymond教授表示:"这项研究令人信服地表明,如果我们想要完全实现个性化医疗并帮助最大数量的患者,就必须评估不同人群中的疾病风险。"
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