这项有价值的研究提供了坚实的证据，支持MuSK的BMP结合域在维持和激活肌肉干细胞（SCs）中的作用。MuSK是一种主要在神经肌肉接头处发挥作用的酪氨酸激酶。这些单核细胞位于肌纤维基底膜和其细胞膜之间，通常处于静息状态，但在肌肉受损后会被激活、增殖并介导肌肉再生。已知这些细胞响应多种信号通路，但本研究认为BMP通过与MuSK结合在维持静息状态中起作用。
RNA测序数据集（GSE121589）来自NCBI的基因表达数据库，该数据集包括从年轻（2-3个月大）和老年（22-24个月大）未受伤和再生肌肉中分离的SCs的批量RNA测序数据。原始数据文件经过TrimGalore!处理以去除适配器和低质量读段，然后使用HiSat2比对到Ensembl GRCm38小鼠基因组。StringTie用于确定每个样本中每百万转录本（TPM）的数量，DESeq2用于识别差异表达基因（DEGs）。使用nCounter面板评估的DE基因的表达情况。显著变化（<0.05）的TPM表示静息SCs（第0天）和早期激活SCs（损伤后第1天和第3天）之间高度调控的基因。
统计分析部分详细描述了假发现率（FDR）的估计方法。最终差异表达基因热图的基因聚类使用fpc R库中的Partitioning Around Medoids方法进行，该方法考虑了路径上所有信号的方向和类型，以及每个基因的位置、角色和类型。超几何分布用于分析路径、基因本体、结构域和其他本体的富集情况。topGO R库用于确定GO术语之间的局部相似性和依赖关系，以执行Elim修剪校正。富集分析参考了多个数据库来源，包括Interpro、NCBI、MsigDB、REACTOME和WikiPathways。富集计算相对于实验相关的背景基因集。基因表达数据导出并在GraphPad Prism 9中生成热图。
补充材料：
补充图1. MuSK在未受伤和再生WT和λIg3-MuSK肌肉SCs中的表达
(a) MuSK的外显子组织。两个可选择剪接的30个核苷酸外显子（5a和5b）用星号表示。用于(b)和(c)面板的PCR引物分别标记为F1和F2。
(b) 来自3个月和5个月大的未受伤WT肌肉的SCs表达全长MuSK；未检测到λIg3-MuSK。来自组成型λIg3-MuSK小鼠静息肌肉的SCs仅表达λIg3-MuSK，如预期。
(c) 来自5个月大的WT肌肉再生5天后的SCs表达全长MuSK，但未检测到λIg3-MuSK。来自λIg3-MuSK小鼠再生肌肉5天后的SCs表达λIg3-MuSK转录本。注意，MuSK在第5和第6外显子之间有两个可选择剪接的30个核苷酸外显子（5a和5b）（图1a）。5b外显子的可选择剪接是检测到多个条带的基础（Jaime等，2024）。
补充图2. λIg3-MuSK和WT小鼠在3个月和5个月龄时多个队列的握力
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