旧金山:SandboxAQ是一家从Alphabet的谷歌分拆出来并得到Nvidia支持的人工智能初创公司,该公司于周三发布了一批数据,希望这些数据能够通过帮助科学家理解药物如何与蛋白质结合来加速新药物的发现。
目标是帮助科学家预测一种药物是否会在人体中与其靶点结合。尽管这些数据得到了实际科学实验的支持,但它们并非来自实验室。相反,SandboxAQ利用Nvidia的芯片生成了这些数据,并将这些数据输入到AI模型中,希望科学家们能够使用这些模型快速预测小分子药物是否会与研究人员所针对的蛋白质结合,这是在候选药物进入下一步之前必须回答的关键问题。
例如,如果一种药物旨在抑制某种生物过程(如疾病的进展),科学家可以使用该工具预测这种药物分子是否可能与参与该过程的蛋白质结合。
这种方法是一个新兴领域,它结合了传统的科学计算技术和AI的进步。在许多领域,科学家长期以来一直有方程可以精确预测原子如何组合成分子。但对于即使是相对较小的三维药物分子,潜在的组合数量也过于庞大,即使使用当今最快的计算机也无法手动计算。因此,SandboxAQ的方法是利用现有的实验数据计算出约520万个新的“合成”三维分子——这些分子虽然没有在现实世界中被观察到,但却是基于现实数据进行计算得出的。
这些公开发布的合成数据可以用于训练AI模型,这些模型可以在短时间内预测一种新的药物分子是否可能与研究人员所针对的蛋白质结合,同时保持准确性。SandboxAQ将为其用这些数据开发的AI模型收费,希望这些模型能够获得与实验室实验相当的结果,但只需虚拟操作。
“这是一个生物学领域长期存在的问题,我们整个行业一直在努力解决,”SandboxAQ的AI模拟总经理Nadia Harhen周二在接受路透社采访时说。“所有这些计算生成的结构都与真实的实验数据相关联,因此当你选择这个数据集并训练模型时,你可以以前所未有的方式使用合成数据。”
来源:路透社
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