塞格德匈牙利国家研究与创新办公室(HUN-REN)生物研究中心的研究人员正参与一项1500万欧元的欧盟"地平线欧洲"(Horizon Europe)计划,该计划将在欧洲临床试验中研究噬菌体疗法与微生物组恢复相结合的方法。反复发作的尿路感染影响全球数亿人,尤其在女性中非常普遍,在许多情况下需要反复使用抗生素治疗。这不仅降低了生活质量,还可能导致耐抗生素细菌的传播并破坏肠道微生物组的正常功能。REPhRAME临床试验的研究人员,包括来自匈牙利的巴林特·金泰什(Bálint Kintses)及其团队,希望这种方法能够帮助打破反复发作的尿路感染的恶性循环,同时保护肠道微生物组。
将噬菌体疗法与微生物组恢复结合为单一策略
反复发作的尿路感染通常不会在急性症状消失后结束。它们可能由在肠道中持续存在并随后重新定植尿路的大肠杆菌(Escherichia coli)菌株引起。抗生素可以暂时抑制这些病原体,但也可能损害微生物组中的有益成员,从而导致进一步的复发。
因此,REPhRAME项目同时针对当前感染及其可能的复发来源之一。治疗的第一步是使用CRISPR增强型噬菌体混合物,专门针对致病性大肠杆菌菌株。噬菌体是感染细菌的病毒,当适当选择时,可以高度特异性地攻击致病细菌。随后是科隆微生物库(Cologne Microbiota Bank)开发的微生物组疗法INTESTIFIX001,旨在恢复肠道中的微生物平衡,可能有助于降低进一步感染的风险。
在欧洲临床试验中测试新方法
REPhRAME项目的核心是一项多国、随机、安慰剂对照的Ib/IIa期临床试验,将评估该治疗方法的安全性、有效性和临床适用性。研究人员将比较三种方法:单独使用噬菌体疗法、噬菌体疗法结合抗生素,以及噬菌体疗法后接微生物组恢复。
该试验不仅将探究噬菌体疗法是否能减少抗生素使用,还将研究在哪些患者群体中、以何种治疗顺序以及在何种微生物学条件下该方法可能最为有效。除了临床结果外,研究人员还将收集微生物学、免疫学和微生物组数据,以更好地了解治疗的作用机制和取得治疗成功的必要条件。
塞格德研究人员聚焦噬菌体疗法中的一个关键问题
由巴林特·金泰什(Bálint Kintses)领导的塞格德匈牙利国家研究与创新办公室生物研究中心(HUN-REN BRC Szeged)转化微生物学实验室在该项目中发挥着重要作用。塞格德研究人员为噬菌体疗法中的一个核心挑战提供了科学基础:如何理解和预测特定噬菌体可以有效靶向哪些细菌菌株。
噬菌体具有高度特异性。这是一个主要优势,因为它提供了比广谱抗生素更精确地靶向致病细菌的可能性。同时,这种特异性也是一个挑战:成功的噬菌体疗法需要详细了解噬菌体与细菌之间的关系,以及这种关系在治疗过程中可能发生的变化。
塞格德实验室基于数据的微生物学和噬菌体疗法方法可能有助于将噬菌体疗法从个案实验性使用推进到可预测、可测量且临床可解释的策略。
塞格德匈牙利国家研究与创新办公室生物研究中心转化微生物学实验室负责人巴林特·金泰什(Bálint Kintses)表示:"噬菌体疗法最大的前景在于其特异性:当适当选择时,噬菌体可以针对引起问题的细菌菌株,而不会广泛破坏细菌群落。然而,要实现这一点,我们需要对噬菌体与细菌之间的关系有精确的理解。REPhRAME项目特别令人兴奋的地方在于,这些知识现在可以作为大型欧洲临床试验的一部分加以应用。"
噬菌体疗法可能进入临床开发的新阶段
REPhRAME项目是欧洲更广泛努力的一部分,旨在将感染细菌的噬菌体转变为受监管的、经过临床验证的治疗选择,用于那些抗生素越来越无法提供持久解决方案的感染。
该项目的独特之处在于,它不是孤立地研究噬菌体疗法,而是将其与微生物组恢复联系起来。这种方法同时针对急性感染和可能导致复发的生物学背景。如果成功,该临床试验可能有助于减少抗生素使用,降低反复感染的数量,并支持噬菌体疗法未来融入欧洲临床实践。
关于REPhRAME项目
REPhRAME项目由法兰克福大学医学中心(Universitätsmedizin Frankfurt)协调。该联盟汇集了来自学术、临床、工业、生物信息学、药物开发、监管和以患者为中心的研究背景的16个合作伙伴。合作伙伴包括SNIPR Biome、弗劳恩霍夫协会(Fraunhofer-Gesellschaft)、德国感染研究中心(German Center for Infection Research)、汉诺威医学院(Hannover Medical School)、科隆大学医院(University Hospital Cologne)、塞格德匈牙利国家研究与创新办公室生物研究中心(HUN-REN Biological Research Centre, Szeged)、里加斯特拉迪什大学(Riga Stradiņš University)、莱顿大学医学中心(Leiden University Medical Center)、Jafral、瑞士生物信息学研究所(Swiss Institute of Bioinformatics)、伯尔尼大学(University of Bern)、苏黎世大学(University of Zurich)、莱斯特大学(University of Leicester)和雷丁大学(University of Reading)。
该项目由"地平线欧洲"(Horizon Europe)资助,将持续五年。它将研究如何将靶向抗菌治疗与微生物组保护和恢复相结合。从长远来看,该计划可能有助于减少抗生素使用,并为噬菌体疗法的临床引入建立科学和监管基础。
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