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高通量筛选:测试数百万分子寻找被忽视疾病药物

Drug discovery explained - Episode 2

韩国英语科技/健康
新闻源:unknown
2025-08-24 00:00:26阅读时长3分钟1337字
高通量筛选被忽视疾病药物研发利什曼病查加斯病微型实验人工智能药物命中化学优化合作成果

内容摘要

本文详细解析高通量筛选技术在被忽视疾病药物研发中的应用,介绍韩国巴斯德研究所与DNDi合作开展的数百万化合物筛选项目,揭示从微小实验环境构建到机器学习应用的全流程挑战,以及通过国际合作推进克氏锥虫病、黑热病治疗的突破性进展,涵盖技术细节、筛选效率、后续药物优化及成功案例。

高通量筛选:测试数百万分子寻找被忽视疾病药物

高通量筛选是一种尖端药物研发技术,通过测试大量分子对抗病原体的效果来识别潜在疗法。无国界药品发现研究所(DNDi)正与全球重要合作伙伴(包括韩国巴斯德研究所)共同运用这一工具。

在加压无菌玻璃舱内,巨型机械臂迅速将微型实验板从一个支架转移到另一个。每块实验板包含约400个微小孔穴,在这里细胞、病原体和分子混合进行超微型实验,随后由软件进行图像采集和分析。玻璃舱外,穿着防护装备的研究人员正密切监控操作流程。

微型实验的复杂设置

韩国城南市(首尔南部科技中心)的巴斯德研究所(IPK)已测试约200万种化合物对抗利什曼病和查加斯病等被忽视病原体。这项大规模工作依托名为高通量筛选的前沿技术。

DNDi通过与英国邓迪大学、日本长崎大学等机构合作,测试了总计400万种化合物。这些化合物来自同意免费共享化合物库的科研机构和制药公司。

高通量筛选原理十分直观:在直径数毫米的孔穴中培养受感染的哺乳动物细胞(包括人类细胞),通过移液管加入分子。每块手掌大的实验板可容纳384个孔穴。几天或几小时后,自动化影像分析观察细胞是否清除感染且未被分子杀死。

"在1毫米直径的液滴中建立最佳生物环境极具挑战性,可能需要数月努力。但一旦实验模型开发完成,我们每天可测试2万至5万个化合物,整个库一周内完成测试!"

——IPK药物发现团队负责人大卫·舒姆

实验微型化的特殊挑战

IPK研究人员指出,使用纳升级液体精确给药改变了流体动力学特性。在如此微小尺度上操作,使从基础生物学实验到高通量筛选的转化成为巨大跨越。

"生物学非常敏感。首要挑战是在5微升液滴中创建微环境,让宿主细胞和寄生虫表现正常。温度至关重要:如皮肤利什曼病需要将温度降低到32-33摄氏度以模拟体外生长条件。"

第二重挑战在于检测。研究人员解释:"常规实验室用显微镜观察感染细胞,现在我们使用高通量成像仪拍摄384孔板,通过算法量化寄生虫并转化为数字结果。"

人工智能助力数据分析

通过荧光染色技术可视化感染,研究人员已从过去量化2-3个维度(如寄生虫数量、感染细胞数量)发展到如今应用机器学习和AI技术,单个细胞可提取5000多个特征。

"这种大数据帮助我们发现新现象,令人振奋!"

——IPK病原体化学生物学实验室负责人吴柱焕

药物"命中"与后续优化

当分子成功清除感染时被称为"命中"。但查加斯病的初始命中率不足1%,且90%的命中化合物会因影响宿主细胞被淘汰。

药物研发团队需进行复杂的化学优化过程,调整剂量并评估安全性。最终只有2-3个候选药物能通过"死亡之谷"阶段。DNDi发现查加斯病筛选56.3万个化合物仅获得0.18%的命中率。

"这本质上是概率游戏。我们需要海量筛选。"

——DNDi发现团队负责人让-罗贝尔·伊奥塞特

突破性合作成果

赛诺菲、诺华、GSK等公司及MMV等非营利组织共享化合物库。成功的合作案例包括:

IPK团队正在开发新的查加斯病检测模型,已建立黑热病药物研发管线。研究人员表示:"与DNDi的合作将最前沿技术应用于被忽视疾病,这种协作模式能真正改善患者生活。"

【全文结束】

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