抗生素是重要的临床工具，用于治疗细菌感染，但我们认识到，抗生素使用的一个重要副作用是破坏生活在人体肠道内的微生物群落。针对细菌病原体的抗生素通常会减少某些细菌群体并降低肠道微生物多样性的次要效应。抗生素还与一些危害相关，如抗生素相关性腹泻和艰难梭菌结肠炎。益生菌已被证明可以缓解这些临床情况，但益生菌能否帮助恢复微生物群落？
在《自然评论胃肠病学与肝病学》（Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology）上发表的一篇新综述论文中，八位科学家全面审查了使用益生菌在抗生素治疗期间和之后恢复肠道细菌群落的证据。这些作者涵盖了临床医学、生物统计学、基础微生物组科学和益生菌微生物学等领域的专业知识，描述了当前的证据，并探讨了益生菌在减轻抗生素对肠道微生物群落破坏方面的潜力和局限性。
科学家们发现，直接解决这一研究问题的研究较少。目前的证据尚未表明益生菌总体上能否将肠道微生物群落恢复到抗生素前的状态。一些研究表明，某些益生菌可以减轻因抗生素使用导致的微生物组功能变化，但关于微生物组成恢复的数据相对较少，并且由于方法论上的弱点而限制了其结论的确定性。其他研究表明，与抗生素一起使用的益生菌会导致微生物群落的变化——不一定是恢复——这些变化有时被解释为有益的，但由于对健康微生物群落组成缺乏明确的认识以及微生物群落如何适应变化的问题，这种解释存在争议。
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