医学在不断进步。随着分析平台的改进，新的身体机制不断被发现和理解。这几乎是顺应时代精神发生的：世界各地多个地方同时出现类似的发现，随后研究者们利用这些发现推动了对这些理解的发展。这种转变体现在突然涌现的大量描述这一现象的出版物上，但这一变化也体现在围绕该发现的研究数量中，并且同样反映在用于描述该机制要素的词汇上。
近来，微生物群落受到了越来越多的关注，相关研究量也呈爆发式增长，但人们对各个术语的确切含义仍存在误解。本文将回顾与身体微生物群落相关的词汇，并解释这些术语之间的区别。
什么是微生物组？
微生物组指的是整个栖息地。该术语包括细菌、真核生物等微生物，还包括构成它们的基因以及影响它们的环境因素。虽然有些人将微生物组的定义仅限于微生物群中基因或基因组的集合，但这种组合更准确地称为宏基因组。
2008年，美国国立卫生研究院启动了人类微生物组计划。该计划对人体内所含的微生物进行测序并编制目录。了解更多信息请点击这里。
什么是微生物群？
微生物群是存在于特定环境中的微生物的独特组合。这些微生物可能包括细菌、古细菌或真核生物。该术语本身源于2001年Lederberg和McCray关于基因组学和蛋白质组学流行语的一篇论文，而“生物群系”一词则早在1920年之前就已存在。微生物群是遗传和环境的共同作用结果。
微生物组 vs. 微生物群
微生物群与微生物组截然不同。虽然微生物组可能包含微生物群，但微生物组不仅仅是微生物群。简单来说，如果把微生物组比作一所房子，那么微生物群就是住在房子里的人。房子里还有家具等其他东西。下一节我们将回顾其中一些组成部分，以及一些听起来相似、看起来相近且容易混淆的词汇。
宏基因组
宏基因组是存在于微生物群中的基因和基因组。宏基因组通过DNA提取（宏基因组学）来识别。识别宏基因组有助于解释特定微生物群的工作方式。
微菌群
微菌群是一个非常古老的术语，但直到最近才被应用于人类。传统上，它主要指的是微观植物。如今，其定义已扩展到涵盖各种细菌和微生物，包括人类肠道菌群。然而，后者意义上的微菌群更适合用于通俗文献。它缺乏医学文献或整个科学领域所需的专指性。
理解免疫治疗药物与微生物组
本文回顾了与微生物群落相关的常用术语。这是系列文章中的第一篇，旨在解释微生物组与免疫治疗药物之间的联系。在我们的下一篇文章中，我们将讨论微生物群对癌症及癌症疗法的影响。敬请期待！
来源
- Gevers D, Knight R, Petrosino JF, et al. The Human Microbiome Project: a community resource for the healthy human microbiome. PLoS Biol. 2012;10(8):e1001377. doi:10.1371/journal.pbio.1001377
- Lederberg J, McCray AT. ‘Ome sweet ‘omics — a genealogical treasury of words. The Scientist. 2001;15(7):8–8.
- Marchesi, J. R., & Ravel, J. (2015). The vocabulary of microbiome research: a proposal. Microbiome, 3, 31.
- Sandhu K.V., E. Sherwin, H. Schellekens, et al. 2016. Feeding the microbiota-gut-brain axis: diet, microbiome and neuropsychiatry. Translational Research. 179: 223–244.
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