乌梅奥大学临床微生物学系正在招募一名专注于生物信息学的医学科学博士生。我们提供一个国际化的、激励人心的、协作式的研究环境，促进您的科学发展。
该项目旨在追踪早期儿童中人类肠道细菌物种的菌株级差异。我们的目标是深入理解不同肠道细菌采用的适应机制，以高分辨率指导下一代微生物组辅助治疗。
关于该职位
研究儿童肠道微生物组群落发展
婴儿肠道微生物组在稳定为类似成人的构型之前会经历快速的组成和菌株级变化。虽然这些动态受到多种早期生活暴露的影响，但微生物组发展的轨迹仍未完全理解。在此项目中，候选人将分析来自500名从出生到三岁儿童的纵向粪便鸟枪法测序数据，以研究环境、临床和生活方式暴露如何塑造微生物群落发展。学生将成为数据驱动生命科学（DDLS）博士研究学校的一员。
关键词： 博士职位、宏基因组学、人类肠道微生物组、鸟枪法宏基因组学、微生物组进化、微生物组、长读长测序、宏基因组组装基因组、菌株水平宏基因组学、高分辨率宏基因组学
被医学院录取攻读博士学位者将参与全校范围的博士教育计划。该博士计划包含25学分，提供两种学习模式：25学分分布在8个学期（总计4年）或12个学期（总计6年），每个秋季和春季学期开始。有关该计划的更多信息可在医学院博士研究手册中查阅。
资格与要求
- 申请人必须拥有至少240个高等教育学分（hc），其中至少60个学分属于高级水平，专业领域为自然科学、生命科学或工程学
- 申请人必须具备良好的英语口头和书面沟通能力，能够独立工作也能与他人合作，并具有高度积极性
优先考虑条件
- 拥有生物信息学、计算生物学、（生物）统计学、（应用）数学、计算机科学或相关领域的学位；其他领域但具备强大编程/编码技能的候选人也可申请
- 至少精通一种编程语言，最好为Python或R
- 在以下任一领域有经验：大规模序列分析、微生物基因组学、人类肠道微生物组研究（鸟枪法宏基因组学）、宏基因组组装基因组构建、肠道微生物基因组和基因数据库开发
- 适应在多元、包容、跨学科和高度协作的环境中工作
- 能够通过命令行导航UNIX文件系统，在conda环境中工作，从github安装和实现软件包，在集群中提交批处理作业
详细信息
该职位由SciLifeLab和瓦伦伯格国家数据驱动生命科学计划（DDLS）资助（提供薪资），这是一个为期12年的计划，旨在招募和培训下一代数据驱动生命科学家。除了隶属于乌梅奥大学临床微生物学系外，您还将隶属于国家DDLS计划，通过该计划您将获得计算资源、国家DDLS研究学校以及其他在整个瑞典的培训和网络机会。
您还将进一步隶属于瑞典分子感染医学实验室（MIMS）；MIMS是北欧EMBL分子医学合作伙伴关系的成员，致力于研究疾病的分子基础并探索分子和基因治疗的新兴生命科学领域。您将有机会与欧洲及全球的专家合作。本地研究小组隶属于于默奥微生物研究中心（UCMR）。UCMR是由代表医学和分子微生物学、分子和结构生物学、化学和物理学的科学家联盟建立的跨学科研究中心，致力于微生物致病领域的高质量研究和新应用。
申请要求
完整申请材料必须包括：
- 一封求职信（一页A4纸），突出您对该职位的具体资格和动机。[例如：您的背景如何与研究领域相符]
- 简历（CV），包括完整的出版物列表。[预印本可接受]
- 学位证书、证明文件和成绩单的认证副本
- 至少2位推荐人的姓名和联系方式
博士职位为期4年，具体开始时间根据协议确定。申请需通过Varbi系统在线提交。
如需了解研究领域的更多详情，请联系：
Chinmay Dwibedi [dwibedilab.org]，chinmay.dwibedi@umu.se
我们欢迎您的申请！
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