异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）后，肠道微生物群的多样性显著下降。这些变化可能是由化疗、抗生素或肠道炎症引起的。大多数患者在中性粒细胞减少期间会接受预防性和治疗性抗生素，部分患者会被ESBL细菌定植。我们研究了allo-HSCT期间肠道微生物群组成的改变，旨在调查获得ESBL定植是否会影响移植期间肠道微生物群的多样性。这是一项单中心前瞻性试点研究。所有连续入住在都灵市卫生与科学城Molinette医院血液科并在2017年8月至2020年8月期间接受allo-HSCT的患者均被纳入研究。从入院到出院，每7天收集一次粪便样本，直到移植后一年。共有48名患者参与了本研究。基线时，14名患者（29.16%）被多药耐药（MDR）细菌定植，主要是产超广谱β-内酰胺酶（ESBL）的革兰阴性菌（n=11；78.57%）。在allo-HSCT期间，一名患者直肠拭子检测出碳青霉烯酶产生肺炎克雷伯菌阳性，八名患者在住院期间失去了定植。比较了基线时ESBL定植患者与未定植患者的肠道微生物群组成。基线时ESBL定植患者中，Bifidobacterium, Blautia, Clostridium, Coprococcus, L-Ruminococcus Mogibacteriaceae, Peptostreptococceae 和 Oscillospira 的丰度较高，而非定植患者中 Actinomycetales, Staphylococcus 和 Sutterella 的丰度较高。此外，在移植后保留ESBL定植的患者中，Akkermansia, Dialister, Erysipelotrichaceae 和 Methanobrevibacter 的丰度增加，而在直肠拭子转阴的患者中，Actinomycetales, Arcanobacterium, Corynebacterium, Streptococcus 和 Lactobacillus 的相对丰度增加。从临床角度看，这项前瞻性试点研究的后续发展将是调查肠道屏障功能标志物、短链脂肪酸（SCFA）生产和这些参数与allo-HSCT人群感染风险及临床结局的相关性。
尽管样本量较小且异质性较大，我们观察到ESBL定植患者中艰难梭菌感染（CDI）的发生率增加。未来的研究和更大的样本量将有助于深入分析。更好地了解多药耐药定植背景下肠道微生物群的组成，将帮助医生针对微生物群进行个性化抗生素治疗，无论是在预防发热性中性粒细胞减少还是在高危人群的经验性治疗中。
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