筑波大学的研究人员开发了一种名为DeMemSeg的AI驱动分析流程,解决了显微镜技术中的一个长期难题:在二维(2D)投影图像中精确分割和测量重叠的单个细胞膜。这项创新有望加速细胞机制及相关疾病的研究。
细胞及其细胞器的形状与其功能密切相关,因此准确测量对于理解基本生物过程至关重要。生物分析通常需要将三维(3D)荧光图像投影为二维进行可视化。然而,在此过程中,三维中分明的结构在二维图像中经常出现重叠,使得单个轮廓的精确分割变得复杂。
为解决这一问题,研究人员开发了DeMemSeg,这是一种基于深度学习的新型AI驱动流程。研究团队以芽殖酵母孢子形成过程中形成的前孢子膜为模型系统,证明DeMemSeg能够自动分割重叠的膜结构,其准确度在统计学上与专家手动分析相当。
此外,当应用于其训练集中未包含的具有异常膜形态的突变细胞时,DeMemSeg成功检测并量化了这些异常,展现出强大的泛化能力。这些结果已发表在《细胞结构与功能》杂志上。
该方法能够对以往难以获取的形态学数据进行大规模、客观和定量的分析,特别是在芽殖酵母研究中。此外,DeMemSeg底层的工作流程可以适应生命科学的其他领域。由于某些人类配子形成和受精障碍涉及细胞或细胞器的形态异常,这些发现为深入理解此类疾病机制提供了基础技术。
更多信息:田口正大等,《基于深度学习的酵母2D投影衍生重叠前孢子膜分割》,《细胞结构与功能》(2025)。DOI: 10.1247/csf.25032
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