欧文·R·怀特博士
学术头衔:教授
主要职位:流行病学与公共卫生
行政头衔:基因组科学研究所副所长;基因组科学研究所研究合作与发展副主任
额外头衔:基因组科学研究所研究合作与发展副主任
电子邮件:owhite@som.umaryland.edu
位置:健康科学设施三号楼,巴尔的摩西街670号,巴尔的摩21201
电话(主要):(410) 706-6751
电话(次要):(410) 706-2396
传真:(410) 706-6777
教育和培训
马萨诸塞大学,生物技术学士,1985年
新墨西哥州立大学,分子生物学博士,1992年
基因组研究所(TIGR),博士后研究员,基因组信息学,1994年
生平简介
怀特博士是一位国际公认的生物信息学专家,拥有超过15年的丰富经验。在马里兰大学医学院,他领导着基因组科学研究所一个由25名科学家和工程师组成的团队,致力于开发用于基因组和宏基因组数据自动化和手动分析的生产级流程、数据库和工具。
怀特博士及其团队设计了社会技术框架,通过共识治理、标准化元数据以及协调的数据处理和共享,支持大型多机构研究合作。他们的工作支持强大的数据摄取、整理、协调和统一处理,以创建FAIR(可查找、可访问、可互操作、可重用)的广泛可访问多组学资源。该团队还开发可视化和分析工具,促进联盟范围内的出版物,并通过外展和合作扩大社区对复杂生物医学数据集的访问。
十年来,怀特博士担任两项NIH资助的数据中心负责人,支持人类微生物组项目和整合人类微生物组项目,产生了超过50,000个异构数据集,总计约10太字节的多组学数据。他还发挥了领导作用,建立了共同基金数据生态系统,担任CFDE协调中心负责人,将12个NIH数据协调中心的数据联合起来。
他的团队为BRAIN计划建立了并维护着神经科学多组学数据档案(NeMO),这是一个包含超过2.6拍字节基因组数据的大型资源,涵盖820多万个文件,跨越批量和单细胞转录组学、表观基因组学和甲基化检测。
怀特博士还是人类病毒组计划的联盟组织和数据协作中心开发的领导者,构建云支持的基础设施,用于存储、协调、分析和传播来自数十万个样本的多组学数据集,以及标准化工作流程和开源工具,以支持整合病毒-宿主研究。
研究/临床关键词
基因组学、转录组学、多组学、数据管理、元数据、标准、本体论、云系统。
突出的出版物
Huttenhower C, Knight R, Brown CT, Caporaso JG, Clemente JC, Gevers D, Franzosa EA, Kelley ST, Knights D, Ley RE, Mahurkar A, Ravel J, 科学家促进微生物组研究, 怀特O. 推进微生物组研究社区. Cell. 2014;159(2):227-30.
Gevers D, Knight R, Petrosino JF, Huang K, McGuire AL, Birren BW, Nelson KE, 怀特O, Methe BA, Huttenhower C. 人类微生物组计划:健康人类微生物组的社区资源. PLoS biology. 2012;10(8):e1001377.
整合人类微生物组计划:人类健康和疾病期间微生物组-宿主组学谱的动态分析. Cell host & microbe. 2014;16(3):276-89.
Fertig, E., Bergman, D.等. "虚拟细胞用于预测性免疫疗法." Nature Biotechnology, 2025年4月14日.
Fertig, E., Lvovs, D., Mahurkar, A., 怀特O. "计算肿瘤学中伦理和可重复的数据共享." Cell Reports Medicine, 2025年4月15日.
获奖和荣誉
- 微生物组先锋奖,2018年
- 本杰明·富兰克林奖(生命科学开放获取),2015年
- 托马斯·路透评选的全球最具影响力的微生物学科学思想家,2014年
- 共同基金工作组成员:建立下一代NIH数据生态系统的原则,持续进行中
- 专家顾问,数据可持续性和维护研讨会 - 弗朗西斯·柯林斯主持,2016年
- Kumho科学国际植物分子生物学和生物技术奖,2001年
新闻报道
2025年4月15日发表在《Cell Reports Medicine》上的一篇文章,主要作者为Dmitrijs Lvovs,合著者包括Elana Fertig、Anup Mahurkar和Owen White。该研究探讨了人工智能在预测健康结果方面的潜力,同时也强调AI不应成为唯一的方法。此研究成果已被《Science Magazine》、《Innovation Reports》、《NewsGram》和《Bioengineer.org》等多家权威媒体报道。
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