Parse Biosciences近日宣布,将全力支持西奈山伊坎医学院(Icahn School of Medicine at Mount Sinai)的研究人员生成一个专注于阿尔茨海默病和帕金森病患者细胞剪接事件的最大规模单细胞数据集。该研究的初始阶段将分析来自1,000多个外周血单核细胞(PBMC)样本、超过1,000万个细胞的转录组图谱。这些分析所积累的数据将为理解、检测和治疗这些疾病提供重要的基础。
“以往关于神经退行性疾病的研究主要集中在疾病的基因组基础诊断上,但很少有人关注可能进一步驱动病理和疾病进展的转录后事件,”西奈山医院功能性基因组学实验室首席研究员、Ronald M. Loeb阿尔茨海默病中心核心教员Towfique Raj博士说道,他将领导这项研究。“我们很高兴能够大规模研究单细胞中的可变剪接事件,以确定疾病发作、进展和严重程度的其他潜在因素。这种规模的研究对于开发基础模型以帮助我们更好地理解神经退行性疾病至关重要。”
Raj博士的研究团队致力于研究包括阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化症(ALS)在内的神经退行性疾病的分子机制。
在本研究中,西奈山团队将对确诊阿尔茨海默病或帕金森病患者的存档PBMC样本进行高通量分析。研究人员计划分析超过1,000个样本,以捕获其单细胞全转录组库数据。这些样本将在西奈山制备完成后送往Parse GigaLab——一个专为生成大规模单细胞RNA测序数据集而设计的先进设施。借助Parse的Evercode化学技术,GigaLab能够快速生成高质量的大规模单细胞数据集。
“我们非常兴奋能够利用GigaLab的强大功能来提升Raj实验室正在进行的有影响力的研究,”Parse Biosciences首席技术官Charlie Roco博士表示,“GigaLab的速度和规模真正加速了研究进程,让我们比以往更快地获得洞见。”
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