摘要
人类肠道微生物组是一个复杂的群落，在健康中发挥着重要作用，其中扰动可能导致菌群失调和疾病。噬菌体（phages）可用于治疗细菌性胃肠道疾病，商业制剂如Intesti噬菌体鸡尾酒可口服以靶向细菌病原体。然而，这些噬菌体与原生肠道微生物群的相互作用研究不足。为调查噬菌体治疗的影响，我们使用模拟肠道模型，该模型接种了来自三名健康捐赠者的微生物群，对DNA进行测序，并分析了随时间获取的样本中的细菌和病毒部分。每位捐赠者具有独特的细菌组成，且随时间分道扬镳。在比较噬菌体处理样本与对照样本时，我们观察到大肠杆菌丰度占细菌群落变异的最大部分，且更与对照组相关。噬菌体处理样本中较低的丰度可能源于鸡尾酒中噬菌体的裂解作用。此外，我们对病毒部分的分析揭示了仅在噬菌体处理样本中出现的噬菌体增殖。这种增殖中一种高丰度噬菌体与Intesti噬菌体鸡尾酒匹配，显示出与肠杆菌噬菌体phi92的相似性，并提供了模型内生产性感染的证据。尽管我们在噬菌体鸡尾酒存在下观察到额外病毒序列相对丰度的波动，但这些变化往往是短暂的。此外，我们仅检测到病毒组典型成员的微小差异和活性前噬菌体的低数量。我们的实验表明，噬菌体鸡尾酒对模型内的原生肠道微生物群干扰最小。
影响声明
噬菌体正日益被研究和测试其治疗感染的疗效，并成为对抗抗菌素耐药性细菌感染的关键组成部分。由于其特异性，几乎成为一种教条，即它们不改变肠道微生物组。我们现在使用商业可用鸡尾酒和真实人类粪便微生物群在体外研究中对此进行了测试。我们展示了噬菌体鸡尾酒对健康微生物群组成的影响最小，仅对大肠杆菌有由鸡尾酒中一种噬菌体的生产性感染引起的个体特异性效应。
【全文结束】
