人类粪便微生物移植对鼻腔和口腔微生物组及抗生素耐药基因谱的纵向影响 - 硒与微生态

人类粪便微生物移植对鼻腔和口腔微生物组及抗生素耐药基因谱的纵向影响Longitudinal Changes in Nasal and Oral Microbiome and Antimicrobial Resistance Gene Profiles in Response to Human Fecal Microbiota Transplantation | bioRxiv

环球医讯 / 硒与微生态来源：www.biorxiv.org美国 - 英语2026-02-02 04:08:28 - 阅读时长2分钟 - 928字

本研究揭示了人类粪便微生物移植(FMT)对上呼吸道微生物生态的深远影响，通过对接受FMT治疗复发性艰难梭菌感染的患者进行纵向追踪，在基线及术后第14天、56天采集多部位样本分析发现：FMT不仅改善肠道微生物多样性，还显著改变鼻腔微生物组结构，导致莫拉菌属扩张及金黄色葡萄球菌等呼吸道病原体减少，同时降低β-内酰胺类等关键抗生素耐药基因丰度；而口腔微生物组保持相对稳定，这一结果为肠-肺轴理论提供了关键实证，证实肠道干预能系统性影响呼吸道微生物组成与耐药模式，对开发新型感染防治策略具有重要指导意义。

摘要

肠-肺轴描述了肠道和呼吸道黏膜系统通过微生物、代谢和免疫通路的相互作用，但针对肠道的疗法对上呼吸道(URT)菌群的系统性影响尚未得到充分探索。我们对接受粪便微生物移植(FMT)治疗复发性艰难梭菌感染(CDI)的成年患者及健康对照组进行了纵向研究。在基线(第0天)及FMT后第14天和第56天收集粪便、鼻腔和口腔样本。通过宏基因组鸟枪测序量化微生物多样性、分类组成和抗微生物耐药基因(ARGs)丰度。FMT与肠道微生物多样性增加相关，同时降低了通常被视为致病共生菌的关键肠道菌群水平，包括克雷伯菌属(*Klebsiella spp.)、大肠杆菌属(*Escherichia spp.)、志贺菌属(*Shigella spp.)和肺炎克雷伯菌(*Klebsiella pneumoniae)。在门水平上，粪便拟杆菌门(*Bacteroidota)增加，而毛霉门(*Mucoromycota)在治疗后减少。FMT后鼻腔微生物组变化包括丰富度和多样性降低、莫拉菌属(*Moraxella)扩张，以及与呼吸道定植相关的菌群减少，包括金黄色葡萄球菌(*Staphylococcus aureus)和肺炎链球菌(*Streptococcus pneumoniae)。到第56天，鼻腔菌群部分恢复至健康状态。基线鼻腔ARG丰度在FMT后下降，特别是β-内酰胺类、氨基糖苷类和氟喹诺酮类耐药基因，并在第56天与健康对照组相当。相比之下，口腔微生物组和口腔耐药组保持相对稳定，仅有轻微波动，且未观察到与呼吸道致病共生菌相关的菌群一致增加。总之，FMT与肠道以外的广泛影响相关，包括上呼吸道微生物生态和抗微生物耐药谱的变化。这些发现一致地证明了肠-肺微生物相互作用，将肠道动态变化与呼吸道微生物组成及抗微生物耐药模式联系起来。