Iambic Therapeutics的研究人员正在公司实验室工作。武田制药将应用Iambic Therapeutics基于人工智能（AI）的技术和湿实验室能力，通过多年期技术与发现合作，在武田的肿瘤学及胃肠道和炎症治疗领域启动小分子药物的设计与开发，该合作可能为这家圣地亚哥生物科技公司带来超过17亿美元的收入。
武田已同意利用Iambic的AI药物发现模型，推进其在肿瘤学、胃肠道及炎症领域的高优先级小分子项目。除上述领域外，武田的治疗重点还包括神经科学、血浆衍生疗法、罕见病和疫苗。
Iambic首席财务官兼企业发展主管迈克尔·塞科拉向《GEN》表示："Iambic在癌症及其他领域已取得成功，我们相信计算与实验方法可广泛应用于不同治疗领域甚至治疗模式。"
通过此次合作，武田将获得Iambic AI药物发现技术的使用权。其中Enchant是一种多模态转换器模型，经药物研发各环节数十种数据模态和来源训练而成，旨在通过实验室数据补充临床数据，实现从研发早期阶段对人类药代动力学等临床药物特性的可靠预测。
去年，Iambic发布了Enchant v2升级版，该模型可精准预测数十种对临床成功至关重要的生物、理化、药代动力学、代谢及安全性等特性。
另一项武田计划应用的技术是NeuralPLexer，这是一种计算方法，仅需输入蛋白质序列和配体分子图即可直接预测蛋白质-配体复合物结构。NeuralPLexer采用深度生成模型，在原子分辨率下采样结合复合物的三维结构及其构象变化。
塞科拉解释道："Iambic的计算与实验技术通过不确定性量化（UQ）和主动学习，在快速设计-合成-测试-分析（DMTA）循环中协同工作。仅做预测是不够的，还需理解预测的确定性及可能扭曲准确预测的偏差。"他补充道："借助此类UQ，可运用主动学习探索哪些参数空间需补充数据甚至规避。我们的计算工具提供生物学的结构视角和化学的广泛影响，随后可在实验室验证优化。"
Iambic表示其自动化实验室能完成超95%的药物化学转化，每周常规生成1000多种分子，从而为合作伙伴更快设计出更优分子。
在2024年发表于《Nature Machine Intelligence》的研究中，Iambic、英伟达和加州理工学院的研究人员报告，NeuralPLexer在准确传达代表性结构对（含大构象变化）和新近确定的配体结合蛋白的全局蛋白质结构方面，持续优于AlphaFold2，这得益于其对配体游离态和结合态集合的特异性采样。
塞科拉表示："武田将获得我们行业领先的NeuralPLexer技术使用权，以微调模型并定向应用于其选择的计算场景。"他补充称，武田对NeuralPLexer的访问为非排他性，将平行于Iambic去年与Revolution Medicines达成的技术赋能和研发合作模式。
在该合作中，双方约定使用Iambic的AI模型开发新型候选药物。Iambic同意利用Revolution Medicines提供的结构和分子库，训练NeuralPLexer的定制版本。Revolution还获得了PropANE模型的访问权——这是一种预训练图神经网络，针对数十种药物特性用于先导化合物筛选优化；而Iambic则承诺基于Revolution Medicines的专有数据构建NeuralPLexer等技术的定制版本，以指导针对新型药物靶点的发现。
塞科拉表示："过去一年我们合作势头强劲，已达成五项重大合作，每项都彰显了Iambic价值主张的广度和深度。"
Revolution和武田是近期与Iambic在AI药物开发领域合作的多家大型生物制药企业中的两家。另两家为：
- 灵北制药（Lundbeck）——2024年9月，Iambic与这家丹麦生物技术公司启动未公开价值的战略研究合作，专注于发现治疗偏头痛的小分子疗法。
- 爵士制药（Jazz Pharmaceuticals）——去年10月，Iambic与爵士制药签订未公开价值的研究合作及药物供应协议。爵士制药同意免费提供Ziihera®（zanidatamab，一种HER2靶向双特异性抗体），供Iambic评估其与IAM1363（Iambic开发的可穿透血脑屏障的HER2小分子酪氨酸激酶抑制剂）联用效果。该组合将在既往接受过Enhertu®治疗的HER2阳性乳腺癌患者中开展研究。
爵士制药合作启动前一个月，Iambic在欧洲肿瘤内科学会（ESMO）大会上公布了IAM1363的I/Ib期试验（NCT06253871）积极数据。结果显示，该药物在HER2野生型和突变型癌症及多种疾病适应症中均展现抗肿瘤活性和良好安全性。
今年6月，Iambic选定AI基础设施开发商Lambda提供NVIDIA HGX B200集群，支持Enchant模型训练。双方此后一直在合作训练Enchant和NeuralPLexer模型。
塞科拉表示："请关注这些模型近期将推出更新更大版本。"
武田已同意向这家圣地亚哥生物技术公司支付未公开金额的预付款、研发费用及技术接入费，并承诺在达成里程碑后支付最高17亿美元以上的款项。Iambic还有资格获得合作产生的任何产品净销售额提成。
谈及合作缘起，塞科拉回忆道："双方长期相互尊重，多个成员曾讨论突破性的药物研发方法，将这些志同道合且雄心勃勃的团队凝聚在一起非常值得。"他援引武田研发总裁安迪·普拉姆1月9日的领英帖文，其中详述了公司AI药物发现策略及合作伙伴选择标准：
"我们优先选择具备独特能力、能增强开发工作的AI伙伴（如Nabla Bio、CytoReason），且其平台已获得临床或强效临床前验证。在数据基础设施及与我们不断发展的AI和机器学习计算能力整合方面，我们青睐具有'快速行动'思维、愿意紧密嵌入团队的伙伴（如TetraScience）。"普拉姆解释道。
他补充道："当这些合作中'全心全意作为一支团队'的精神占主导时，就能取得惊人进展。"
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