我们的研究考察了细胞外囊泡(EVs)中的RNA如何提供与肥胖相关的代谢表型的见解。通过使用功能基因组学方法,我们发现这些EV中的RNA货物中,高比例的基因和调控元件之前已被发现与肥胖和2型糖尿病有关。值得注意的是,这些EV转录本代表了脂肪组织中的调控元件和转录活跃的基因,并与包括体重指数和2型糖尿病在内的代谢表型相关。
我们提供了一个蓝图,将EV转录组分析与遗传学方法相结合,最终可能有助于开发新的诊断和治疗策略,提高我们预测、预防和治疗肥胖相关疾病的能力。
我们旨在了解肥胖个体和瘦弱个体之间的循环EV景观及其差异。我们的重点是EV RNA货物在肥胖和瘦弱个体之间的变化,以及将其与大规模人群基因组和转录组数据库整合如何提供关于肥胖生物学的见解。
我们优化了从减肥手术中获取的脂肪组织培养物中提取和分离循环EV以及生成转录组数据的方法。与范德比尔特大学医学中心的Ravi Shah博士和Eric Gamazon博士合作,我们在计算方法上进行了创新,将EV转录组学与人群“组学”数据(如全基因组关联研究(GWAS)、全转录组关联研究(TWAS)和全表型关联研究(PheWAS))整合在一起。
我们的研究结果表明,肥胖中EV-RNA的差异主要由脂肪组织释放的EV驱动,这些EV中的RNA来自脂肪组织内的不同细胞类型。通过使用功能基因组学方法,我们鉴定出282个在瘦弱和肥胖个体循环EV中差异表达的转录本(对应277个独特的基因符号)。
我们的研究概述了一种将EV转录组学与大规模遗传学研究整合的方法。它还表明,在肥胖中差异表达的EV-RNAs与代谢表型相关的基因(如肥胖和2型糖尿病)有关。这些EV-RNAs代表了脂肪组织中的调控元件和转录活跃的基因,并与代谢表型相关。
我们目前正在研究这些EV转录本在体重减轻(无论是通过手术还是药物,如GLP-1受体激动剂)时的变化。我们还在研究脂肪EVs如何向其他细胞(如心肌细胞、肝细胞和脑细胞)发出信号,以介导肥胖相关的共病。我们的功能基因组学研究已经找到了可能用于治疗这些疾病的靶点。
来源:
Mass General Brigham
参考文献:
Chatterjee, E., et al. (2025)。细胞外囊泡转录组提供与肥胖疾病易感性相关的组织特异性功能基因组注释。Cell Genomics。doi.org/10.1016/j.xgen.2025.100925。
【全文结束】

