新生儿接触抗生素会由于肠道微生物群的变化而削弱对疫苗的免疫反应。每年，免疫接种计划通过预防可预防疾病拯救了数百万人的生命。然而，个体对疫苗的免疫反应差异显著，在高风险感染疾病的人群中，免疫效果可能会不理想。越来越多的证据表明，肠道微生物群的差异可能是导致这些变化的关键因素。
最近发表在《自然》杂志上的一项澳大利亚研究发现，新生儿在出生后的几周内接受抗生素治疗，由于肠道中双歧杆菌（一种生活在人体胃肠道中的细菌）数量减少，其对疫苗的免疫反应较弱。使用益生菌补充剂如Infloran来恢复肠道微生物群中的双歧杆菌显示出有希望的结果，能够恢复免疫反应。
研究人员跟踪了191名健康的、经阴道分娩的婴儿，从出生到15个月。86%的参与者在出生时接种了乙型肝炎疫苗，并在六周大时开始按照澳大利亚国家免疫计划接种常规儿童疫苗。
根据抗生素暴露情况将婴儿分组：无直接或母体暴露、暴露于母体抗生素并在新生儿护理期间接受了至少48小时的抗生素治疗。
为了监测肠道微生物群和疫苗相关免疫反应随时间的变化，研究人员在婴儿7天和6周大时收集粪便样本，并在6周至15个月之间多次采集血液样本。为了防止样本收集和分析过程中的偏见，收集样本的研究人员并不知道哪些婴儿属于哪个暴露组。
研究发现，新生儿期直接接触抗生素的婴儿，而不是那些仅暴露于母体抗生素的婴儿，产生了较低水平的针对13价肺炎球菌结合疫苗（PCV13疫苗）中多种多糖的抗体。
肺炎链球菌是一种已知会导致严重疾病如肺炎、血液感染和脑膜炎的细菌，其表面有一层由多糖组成的荚膜，有助于细菌逃避身体免疫系统的攻击。PCV13疫苗通过将多糖荚膜与蛋白质连接起来，使免疫系统更容易攻击肺炎链球菌并产生抗体。新生儿期接触抗生素会降低对这种多糖的抗体生产，从而削弱免疫反应。
无菌小鼠实验表明，较低的免疫反应与肠道微生物群中双歧杆菌丰度的减少有关。然而，给小鼠补充双歧杆菌混合物或常用的婴儿益生菌Infloran，可以帮助逆转抗生素的负面影响并恢复对PCV13的免疫反应。
研究人员建议，在接种疫苗前恢复抗生素暴露婴儿的健康双歧杆菌丰富的微生物群，可能会增强疫苗的抗体反应，从而更好地保护他们免受传染病的侵害。
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