一项基因组监测研究在肯尼亚、乌干达和约旦发现了几种高耐药性（MDR）、高风险的大肠杆菌（Escherichia coli）和克雷伯氏菌（Klebsiella pneumoniae）克隆，研究人员本周在《新发传染病》杂志上报告了这一发现。
利用美国武装部队健康监测部门运行的抗菌素耐药性（AMR）监测项目，研究人员分析了2012年至2022年间从这三个国家的医疗相关感染和社区获得性感染患者中收集的MDR大肠杆菌和克雷伯氏菌分离株。共测试了758株大肠杆菌和378株克雷伯氏菌，检测了它们对不同类别的抗生素的敏感性，并进行了全基因组测序（WGS）。
遗传多样性的高风险MDR克隆
在大肠杆菌分离株中，有124种序列类型（STs），其中20种在三个国家之间共享。主要的ST是ST131，该型已发展成为全球导致MDR尿路感染的主要原因，其次是ST1193，这是一种最近从ST131分化出来的高风险克隆。还鉴定出了三种潜在的动物源性大肠杆菌STs（ST10、ST95和ST117），这些STs在食品动物中常见且具有致病潜力。
在克雷伯氏菌分离株中，有123种STs，其中ST14、ST147、ST307和ST258被认定为最令人担忧的克隆。WGS显示，50.8%的大肠杆菌分离株和68.8%的克雷伯氏菌分离株携带获得性广谱β-内酰胺酶（ESBL）基因，而1%的大肠杆菌和12%的克雷伯氏菌分离株检测到了碳青霉烯酶基因。移动型多粘菌素抗性（MCR）基因在2株大肠杆菌分离株（MCR-1.1）和5株克雷伯氏菌分离株（MCR-8.1和MCR-9）中被发现。
“总体而言，我们的研究突显了两种最关键耐药细菌群体中遗传多样性高风险MDR克隆的出现及其威胁。全球高风险STs携带抗性基因的丰富度表明其有效传播，抗性基因在同种和异种之间的传播潜力，以及新的高风险克隆的出现。”研究作者写道。
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