与耶鲁医学院肺病、重症监护和睡眠医学主任纳夫塔利·卡明斯基博士的对话
2025年5月9日
By Keith Loria
专题文章
耶鲁医学院肺病、重症监护和睡眠医学主任纳夫塔利·卡明斯基博士和他的同事们在应用高通量、基因组规模转录谱分析晚期肺疾病方面是先驱。
纳夫塔利·卡明斯基博士
耶鲁医学院肺病、重症监护和睡眠医学主任纳夫塔利·卡明斯基博士将他的大部分职业生涯致力于研究特发性肺纤维化（IPF）。卡明斯基是本世纪初最早使用微阵列技术对IPF肺部进行分子谱型分析的研究者之一。他在匹兹堡大学时创立了最早的IPF专用中心之一，该中心拥有首个针对该疾病的生物库、首个全州范围的登记系统以及首个支持小组。
多年来，卡明斯基与患者社区建立了深厚的关系，并取得了一些关键发现，包括首次发现蛋白质和基因外周血生物标志物、新的机制，以及最近发现的人类IPF中的新型细胞群体。
卡明斯基和他的同事们在应用高通量、基因组规模转录谱分析晚期肺疾病方面是先驱。他们的主要科学成就包括发现了具有显著作用的新分子（如MMP7、MMP19、SHP2和MKP5），证明了微小RNA（特别是let-7、mir-29和mir-33）在IPF中表达不同且机制上参与其中，并发现通过分析血液中的蛋白质和基因可以预测IPF患者的预后。
卡明斯基在接受《MHE》采访时谈到了他的研究以及对未来慢性肺病如IPF的研究展望。
您能否详细说明您的团队在研究中使用的具体高通量技术，以及这些技术如何增强我们对肺病机制的理解？
我的团队利用单细胞和核测序及空间技术进行谱型分析，构建人类体外三维疾病模型，并采用基于AI的分析方法来预测和加速药物发现。我们关于这一主题的第一篇论文刚刚被接受。我们和其他人已经取得了重大发现，例如单细胞技术彻底改变了我们的领域，因为我们发现了以前未知的细胞群体——异常基底样细胞，这些细胞是纤维化的驱动细胞。
您如何看待遗传和表观遗传信息在未来个性化治疗策略中的作用，尤其是在IPF和慢性阻塞性肺病（COPD）等慢性肺病中的应用？
我们对IPF的遗传学有很好的理解，对COPD也有一定程度的了解，但这些信息尚未影响到治疗。我相信在未来几年，将出现更多针对特定途径和驱动机制的疗法。例如，针对具有特定基因突变或内型的患者，如短端粒。
您认为研究人员和临床医生在将传统诊断方法转变为更个性化的模式时面临的最大挑战是什么？
我直说吧——研究和转化总是很难，但现在联邦政府对研究资金和学术机构的攻击使得这变得不可能。我们现在观察到NIH资助的几个月延迟，不稳定性和缺乏明确性。研究需要连续性、资金和稳定性。资助冻结、间接费用威胁、提议削减NIH预算以及签证延误正在威胁我们在IPF和COPD方面取得的进展，这些疾病在之前就已经资金不足。
微生物组如何与慢性肺病中的遗传因素相互作用，这对开发靶向疗法有何影响？
到目前为止，我们几乎没有证据表明肺部微生物组是一个重要的参与者，在IPF中抗生素试验也未显示出益处。可能我们找错了地方，肠道或口咽微生物组更为重要。现在还为时尚早，无法确定。
展望未来，您认为哪些关键趋势或创新将在未来十年内塑造慢性肺病治疗和患者管理的发展？
基于单细胞数据的见解，利用生物工程和AI方法改变疾病治疗范式，从抑制或激活途径转向重新编程肺部以实现再生和修复。
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