新冠疫情迫使全球数百项临床试验暂停。这段特殊时期虽然对制药和生物医学领域造成挑战，但也促使研究者探索创新工作方式。强生旗下杨森研发公司与比尔·盖茨私人办公室盖茨风险投资公司由此展开公私合作，该项目由杨森神经科学领域前全球负责人Simon Lovestone爵士主导，旨在资助针对已有生物样本（来自健康人群和神经退行性疾病患者）的新一代蛋白质组学分析。
"阿尔茨海默病已成为全球医疗系统的重大负担，这促使我们深入考察该领域研发现状，与数十位专家对话后发现，慈善资金在此领域应发挥催化作用——既不替代联邦拨款或药企投资，又要做出推动领域发展的战略决策。"盖茨风险投资公司健康与生命科学部主管Niranjan Bose博士在接受《技术网络》采访时强调。
该合作最初支持利用SomaScan® 7K平台对2万份现存患者样本进行蛋白质组学分析。这项合作奠定了全球神经退行性疾病蛋白质组学联盟（GNPC）的基础，该联盟是首个针对神经退行性疾病的最大规模蛋白质生物标志物研究项目。截至2023年正式成立时，已有23个合作伙伴，累计收集3.5万份样本（包括血浆、血清和脑脊液）。这些数据构建了包含2.5亿个独特蛋白质测量值的V1整合数据集。
GNPC的总体目标是通过扩展神经退行性疾病分子机制认知来提升诊断和治疗效果。Bose解释道："我们需要超越单个生物标志物如p-tau217，通过蛋白质组学寻找能区分共病病理的特征组合。"特别值得注意的是，该联盟还分析了10-20年前的队列数据，以发现早期疾病预测信号。
2024年6月V1数据集向联盟内部开放，2025年6月通过阿尔茨海默病数据倡议的AD Workbench平台向公众开放。其中40%样本具有纵向追踪数据，大部分来自患者群体。除主要采用SomaScan 7K技术外，部分样本也使用质谱分析方法。《自然医学》2025年7月发表的系列论文展示了初步成果：
• Ali等学者分析10,527份血浆样本发现：阿尔茨海默病关联5,187种蛋白，帕金森病3,748种，额颞叶痴呆2,380种。免疫系统、糖酵解和基质相关通路在各类疾病中普遍存在
• 雪梨大学Caitlin Finney博士团队利用机器学习分析脑脊液、血浆和脑组织样本，发现APOE ε4基因相关的炎症免疫特征在阿尔茨海默病及其他神经退行性疾病中普遍存在
目前GNPC正在推进V2整合数据集建设，重点提升全球人群代表性。V2将纳入来自中南美洲、亚洲和非洲10个队列的5万份样本，采用Olink® Explore HT、NULISA™技术及扩展版SomaLogic 11K平台。Bose强调："我们将创建首个多技术平台对比数据库，供学界评估不同技术在神经退行性疾病研究中的应用价值。"
在执行层面，这种大规模国际合作面临多重挑战：需要协调多方机构、国家和科技公司；改进知情同意流程；强调数据共享价值；以及确保持续资金投入。盖茨特别指出："许多样本来自政府资助项目，美国国立卫生研究院等机构近期经费削减将影响这类前沿生物数据采集，此刻正需要增加而非减少研发投入。"
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