DNA甲基化时钟算法在多种组织类型中的特征研究Research explores DNA methylation clock accuracy across tissues

环球医讯 / 健康研究来源:www.msn.com美国 - 英语2025-02-14 00:00:00 - 阅读时长2分钟 - 718字
研究人员发现,尽管常用的“DNA甲基化时钟”在血液样本中表现良好,但在其他组织如肺、结肠和肾脏中的可靠性较低。这项研究测试了八种不同的DNA甲基化时钟在九种人类组织类型中的应用,并分析了来自基因型-组织表达(GTEx)项目的973个组织样本的数据。
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DNA甲基化时钟算法在多种组织类型中的特征研究

一篇新的研究论文于2025年1月3日在《衰老》(Aging-US)杂志第17卷第1期上发表,题为“应用于多种组织类型的DNA甲基化时钟算法的特征研究”。

芝加哥大学和匹兹堡大学的研究人员Mark Richardson、Courtney Brandt、Niyati Jain、James L. Li、Kathryn Demanelis、Farzana Jasmine、Muhammad G. Kibriya、Lin Tong和Brandon L. Pierce研究了如何使用DNA来测量生物老化。他们的研究发现,尽管常用的“DNA甲基化时钟”在血液样本中表现良好,但在其他组织如肺、结肠和肾脏中的可靠性较低。

DNA甲基化时钟广泛应用于法医学、表观遗传学和长寿研究中,通过DNA的化学变化来估计一个人的生物学年龄。这些表观遗传时钟帮助科学家预测与年龄相关的疾病,并评估生活方式因素(如吸烟)对老化的影响。大多数DNA甲基化时钟最初是使用血液样本开发的,其在其他组织中的有效性尚不清楚。这项研究测试了八种不同的DNA甲基化时钟在九种人类组织类型中的应用,包括肺、前列腺、卵巢、骨骼肌和肾脏。研究人员分析了通过基因型-组织表达(GTEx)项目收集的973个组织样本的数据。

他们的分析揭示了不同组织之间生物学年龄估计的显著差异。虽然血液样本提供了最可靠的结果,但其他组织显示出明显的变异。例如,睾丸和卵巢组织显得比预期年轻,而肺和结肠组织显得更老。

“这些跨组织类型的差异在仅使用血液DNA训练的时钟(如Hannum)中最为明显,但在使用多种组织类型训练的时钟(如Horvath,一种设计用于泛组织年龄预测的时钟)中也存在。”


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