疟疾仍然是全球最严重的传染病之一,消除疟疾的进展正日益受到抗杀虫剂蚊媒、抗疟药物耐药寄生虫、诊断逃逸变体以及传播动态变化的威胁。基因组学、功能基因组学、高通量测序、生物信息学和计算生物学的最新进展彻底改变了我们研究这些挑战背后遗传和进化机制的能力。这些技术为我们提供了前所未有的洞察力,帮助我们了解寄生虫和媒介种群结构、宿主-病原体相互作用、传播网络、耐药性进化、疫苗靶点多样性以及流行病学趋势。同时,基因组监测正成为疟疾控制和消除项目的重要组成部分,支持基于证据的决策和创新干预措施的开发。利用这些进展提供了新的机会,可以加强疟疾研究,改善公共卫生应对措施,并加速实现可持续疟疾控制和消除的进展。
本研究专题旨在展示基因组学和后基因组学方法如何转变疟疾研究,并为威胁疟疾控制和消除努力的新挑战提供创新解决方案。尽管近几十年来取得了重大进展,但当前干预措施的有效性正日益受到蚊媒中杀虫剂耐药性升级(超级耐药性)、寄生虫中抗疟药物耐药性、诊断逃逸变体以及可能影响疫苗效力的遗传多样性的破坏。此外,我们对寄生虫-媒介-宿主相互作用、传播动态以及驱动寄生虫和媒介适应的进化过程的理解仍存在重大空白。
我们致力于汇集利用基因组学、转录组学、功能基因组学、生物信息学、计算生物学和基因组监测来应对这些挑战的多学科研究。投稿可包括原始研究、系统综述和荟萃分析、方法学进展,这些研究可以增进我们对疟疾生物学的理解,识别新的耐药机制,增强监测系统,支持诊断工具、药物和疫苗的开发,并为基于证据的疟疾控制策略提供信息。最终,本研究专题旨在促进科学创新,并加强组学数据在疟疾研究、政策和公共卫生实践中的整合。
本研究专题欢迎探索应用基因组学、转录组学、功能基因组学、生物信息学和计算方法来应对疟疾研究和控制中当前和新兴挑战的投稿。感兴趣的主题包括但不限于:寄生虫和媒介种群基因组学和转录组学;抗疟药物和杀虫剂耐药性的基因组监测;耐药机制的功能表征;宿主-寄生虫-媒介相互作用;传播动态和进化基因组学;诊断耐药性和诊断性能的基因组决定因素;疫苗靶点多样性和免疫逃逸;微生物组和共生体基因组学;多组学方法;基因组流行病学;以及将基因组数据整合到疟疾控制和消除项目中。
我们鼓励提交原始研究文章、系统综述和/或荟萃分析、方法论文、社论、病例报告、病例系列、数据报告和观点文章,这些文章可以推进知识并促进基因组学在疟疾研究和公共卫生中的创新应用。
关键词:基因组学、转录组学、杀虫剂耐药性、药物耐药性、疫苗、疟疾、生物信息学
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