NCSA和俄亥俄超级计算中心利用高性能计算应对心房颤动NCSA and Ohio Supercomputer Center HPC Take on Atrial Fibrillation

环球医讯 / 心脑血管来源:insidehpc.com美国 - 英语2025-08-13 06:03:19 - 阅读时长2分钟 - 902字
俄亥俄州立大学研究人员利用NCSA和俄亥俄超级计算机中心的高性能计算资源,成功进行了长达24小时的心脏电生理活动模拟,揭示了心房颤动导致心脏细胞钙平衡适应性改变进而形成恶性循环的机制。该研究首次实现了心房颤动长期进展的全周期追踪,为开发新型治疗方法和测试针对细胞内调控的疗法奠定了基础,标志着心脏电生理模拟技术进入天级计算新纪元。
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NCSA和俄亥俄超级计算中心利用高性能计算应对心房颤动

Nicolae Moise是俄亥俄州立大学(OSU)生物医学工程系的研究科学家,他正利用国家超级计算应用中心(NCSA)和俄亥俄超级计算机中心(OSC)的高性能计算资源,探索心房颤动(AF)的长期发展进程。其研究成果近期发表于《JACC:临床电生理学》期刊。

心房颤动是一种心脏上部腔室(心房)与下部腔室不同步跳动的异常心律。这种病症起初表现为偶发性,随着时间推移会演变为永久性病变。Moise团队通过心脏电生理模型发现,短期心脏活动(毫秒至秒级)会引发心脏组织的长期改变(天至月级)。"我们进行的模拟迄今为止持续时间最长,成功实现了连续24小时的二维电生理活动模拟。"Moise表示。

研究人员通过模拟技术实现了对心脏长期变化的全面控制。虽然心脏运作看似简单,但精确模拟人类心脏电生理活动需要海量计算。Moise通过美国国家科学基金会的ACCESS计划,获得了在NCSA的Delta超级计算机上进行复杂心脏模拟的计算资源。"通过Delta超级计算机的NVIDIA GPU执行CUDA代码,我们实现了超长时程模拟,模拟速度提升了约250倍。"Moise解释道,"原本需要约一年时间完成的模拟现在仅需一周,这使得深入研究成为可能。"

研究团队发现了心房颤动引发的特殊心脏行为:快速心跳会促使心肌细胞调整钙离子平衡。这种适应性机制虽然维持了短期稳定,但导致心脏对心律失常的敏感性增加,形成恶性循环。"更多心肌细胞为维持钙平衡发生适应性改变,反而使心脏更容易出现心律失常,最终导致永久性心律异常。"Moise强调早期治疗的重要性,"我们的研究首次完整追踪了这种常见心律失常(占脑卒中重要原因的50%)的发病机理,将推动预防和治疗药物的研发。"

这项研究开创了心脏电生理模拟的天级时间维度,不仅可应用于窦房结功能障碍或心肌梗死后心律失常研究,更为大时间尺度生物问题研究提供了新方法。Moise团队计划在后续研究中引入潜在治疗方法,并通过实验验证模拟结果。相关早期研究成果已发表于《生物物理杂志》。

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