关于本研究专题
由于首卷研究专题取得成功，我们决定启动《粪菌移植：将微生物组研究转化为临床应用的挑战》第二卷。粪菌移植（FMT）是一种将健康供体粪便物质移植至患者肠道的医疗程序，主要用于治疗胃肠道疾病。该技术通过恢复肠道微生物平衡，已多次证实能有效缓解症状并改善患者整体健康状况。历史记载显示，异食粪便（即摄入他人粪便）的实践可追溯至3000年前。过去十年间，美国食品药品监督管理局（FDA）将粪便归类为生物制剂，除治疗复发性艰难梭菌感染外均需申请新药研究许可——该适应症因每年可挽救数千生命而被豁免许可要求。目前全球已注册500余项粪菌移植临床试验，探索其在克罗恩病、溃疡性结肠炎、抗生素耐药性、菌群失调、便秘及肠易激综合征等疾病中的应用。然而首卷研究揭示：需深入理解FMT疗效的个体差异、移植菌群的长期稳定性，以及宿主生活方式与环境因素对菌群定植和临床结局的影响。
同时，肠道微生物在健康与疾病中的作用取得重大突破，短链脂肪酸、迷走神经及细胞因子介导的肠-器官轴通信机制获得大量实证。鉴于菌群失调与多种疾病的强关联性，肠道微生物组及其代谢组已成为未来治疗靶点。继发现肠-脑轴后，肠-胰腺轴、肠-肝轴、肠-皮肤轴、肠-肺轴等新通路陆续被证实。相关研究正探索益生菌对神经发育障碍、阿尔茨海默病、帕金森病、代谢综合征、胰腺炎、哮喘及过敏等疾病的潜在疗效。
研究数据表明，供体重要健康背景特征（如抗生素耐药性、糖尿病或肥胖易感性）可能随移植转移，因此FMT不应被视为低风险干预。由于多种肠道微生物体外难培养且特性未明，预测菌群移植可能传播的其他疾病构成重大挑战。必须将肠道内外微生物互作机制，与菌群失调和疾病的现有相关性证据相结合。首卷研究已指出供受体分子兼容性认知缺口，包括微生物组功能匹配、代谢谱及表观遗传互作对FMT成功的影响。该卷建议整合宏基因组学、代谢组学、蛋白质组学等多组学数据与人工智能分析方法，以阐明作用机制并提升临床预测能力。
当前亟需探讨：最新肠道微生物组研究成果如何优化粪便样本筛查方法？筛查应仅针对粪便样本还是涵盖供体全部生活方式？鉴于肠道微生物对表观遗传的影响，筛查是否需包含基因突变检测？FMT涉及哪些伦理考量？首卷成果强调了若干未解问题：FMT获益的长期持续性、供体菌株随时间的存留能力、生活方式对稳定性的调控作用，以及儿科、老年和免疫缺陷等特殊人群的差异化疗效。
本专题接受以下类型稿件：假说与理论、方法学、小型综述、观点论述、原创研究、病例报告、临床试验报告、视角分析、综述及技术代码类文章，重点研究FMT基础微生物学问题。核心议题包括：
- 粪菌移植样本采集、储存及疾病筛查（含耐碳青霉烯类肠杆菌）
- FMT递送方法的优势与风险评估
- 从菌群失调到菌群平衡：对比粪菌移植与益生菌摄入、饮食调控的微生物生长管理
- 微生物组变化的病理生理机制
- 人工智能驱动的多组学整合（代谢组学、宏基因组学等）提升FMT结局预测精度及应答生物标志物识别
- 受体中供体菌群的长期稳定性：决定持续定植的关键因素，饮食、生活方式与环境暴露（暴露组）对FMT定植的影响
- FMT在耐碳青霉烯类肠杆菌感染、自闭症、多动症、克罗恩病、结肠炎、癌症、肥胖、自身免疫病、阿尔茨海默病、帕金森病、多发性硬化症、抑郁焦虑等疾病中的微生物组改变
- FMT相关伦理考量，包括知情同意、供体筛查及长期随访
- 特殊人群（儿科、老年、免疫缺陷）FMT应用：安全性、方案调整及精准化策略
关键词：FMT，粪菌，微生物组，移植
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