摘要
背景
端粒长度(TL)是生物衰老的生物标志物,但其与阿尔茨海默病(AD)的关联尚不明确。
方法
我们使用TelSeq方法,从阿尔茨海默病测序项目(ADSP)的35,014名参与者的全基因组测序数据中估算TL。经过质量控制后,数据集包含6,973名欧洲裔(EA)、4,188名非裔美国人(AA)、4,005名加勒比西班牙裔(CH)和4,170名美国原住民西班牙裔(NAH)个体。TL经过对数转换,并根据年龄和血细胞计数进行调整,然后进行z-score标准化。将标准化后的TL分为长TL组(TL > 0)和短TL组(TL ≤ 0)。在每个祖先群体中,使用逻辑回归模型(包含SNP和TL主效应以及SNP×TL交互项)进行AD全基因组关联研究(GWAS),以分析TL与次要等位基因计数大于20的变异之间的交互作用。
结果
AD风险与较短的TL相关(β = -0.48, P < 2×10⁻¹⁶)。较长的TL与APOE ε2等位基因剂量相关(P = 3.40×10⁻⁴),而较短的TL与APOE ε4等位基因剂量相关(P = 7.05×10⁻³)。在欧洲裔群体中,SEMA6A(P = 1.42×10⁻⁸)和LOC105378654(P = 4.17×10⁻⁸)基因内的变异、IL15与INPP4B基因间区域(P = 1.77×10⁻⁸)以及RP11-2N5.2上游区域(P = 4.60×10⁻⁸)的变异与TL存在全基因组显著(GWS)的交互作用。在美国原住民西班牙裔群体中,在BSN基因的内含子变异(P = 3.26×10⁻⁸)和MST1基因的错义变异(P = 3.26×10⁻⁸)中观察到GWS交互作用。在总样本中,CTD-2160D9.1与EEF1A1P20之间(P < 1.19×10⁻⁸)、TBC1D22A基因内(P = 1.06×10⁻⁸)以及PLK1基因内(P = 3.28×10⁻⁸)的变异与TL存在GWS交互作用。
结论
我们鉴定出一些通过其与TL的交互作用而显著影响AD风险的变异,表明端粒维持通路可能是AD发病机制的核心。
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