胃癌微生物组与临床病理因素关系:基于10万基因组计划和癌症基因组图谱的宏基因组研究The relationship between the gastric cancer microbiome and clinicopathological factors: a metagenomic investigation from the 100,000 genomes project and The Cancer Genome Atlas

环球医讯 / 硒与微生态来源:www.springermedicine.com新加坡 - 英语2025-08-21 04:24:21 - 阅读时长2分钟 - 612字
本研究基于10万基因组计划和癌症基因组图谱的529个胃癌样本进行了宏基因组分析,系统研究胃癌微生物组与临床病理因素的关联。研究发现Prevotella、Selenomonas等菌属在肿瘤组织中普遍存在,微卫星不稳定性、较低的病理浸润深度、肠型组织学和亚洲起源的胃癌样本中微生物丰度和α多样性显著升高,性别和病理浸润深度与微生物组组成相关,提示微生物组差异可能具有潜在临床价值。
胃癌微生物组临床病理因素宏基因组研究微生物丰度α多样性微卫星不稳定性肠型组织学治疗反应预后
胃癌微生物组与临床病理因素关系:基于10万基因组计划和癌症基因组图谱的宏基因组研究

背景

此前胃癌微生物组研究结果存在矛盾,可能源于患者个体差异或肿瘤异质性。胃癌组织内微生物组特征及其与临床病理参数的关系尚未明确。本研究提出假设:胃癌微生物的丰度、α多样性及组成差异与临床病理特征存在相关性。

方法

对529例胃癌样本进行宏基因组分析,整合癌症基因组图谱(TCGA)的外显子组测序数据和10万基因组计划的全基因组测序数据。比较微生物丰度、α多样性及组成在患者年龄、性别、肿瘤部位、地理起源、病理浸润深度、淋巴结转移状态、组织学表型、微卫星不稳定性状态及TCGA分子亚型等变量间的差异。

结果

胃癌微生物组特征与既往研究一致,在两个队列中均检测到Prevotella、Selenomonas、Stomatobaculum、链球菌属(Streptococcus)、乳杆菌属(Lactobacillus)及毛螺菌科(Lachnospiraceae)等优势菌属。TCGA队列显示,微卫星不稳定型胃癌、浸润深度较低、肠型组织学及亚洲起源的肿瘤样本中微生物丰度和α多样性显著升高。微卫星不稳定性状态与两个队列微生物组组成显著相关。在TCGA队列中,性别和病理浸润深度与微生物组组成相关。

结论

胃癌组织微生物组呈现临床病理特征相关性,部分预后良好因素(如微卫星不稳定性和肠型组织学)与更高微生物丰度和多样性相关。这提示需进一步研究微生物组差异的生物学机制及其潜在临床转化价值,包括对治疗反应和预后的影响。

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