新版人类蛋白质图谱将蛋白质与细胞、组织和疾病联系起来，推动精准医学研究
了解人类蛋白质组取决于知道蛋白质的位置及其相互作用方式。新发布的人类蛋白质图谱(HPA)提供了跨越细胞、组织和血液的这些数据。
人类蛋白质图谱对蛋白质组研究的重要性
人体中表达的全部蛋白质集合，通常称为蛋白质组，是理解健康维持和疾病发生机制的核心。研究人员需要详细的地图来显示蛋白质在特定组织、细胞和血液中的位置，以便追踪疾病机制或识别新的治疗靶点。
HPA一直是该领域的关键开放资源，提供数千种人类蛋白质的基于抗体的图像和表达数据。
然而，重要的缺口一直存在。许多疾病和生命阶段的血液蛋白质谱一直不完整，许多组织中的单细胞分辨率数据仍然稀少。蛋白质-蛋白质相互作用的结构信息最近才开始整合。
这些元素的缺失限制了该图谱在转化医学和精准医学研究中的实用性。
最新发布的人类蛋白质图谱版本旨在扩展血液、细胞和组织的数据覆盖范围——增加了疾病分析、蛋白质相互作用结构和单细胞分辨率的新功能。
人类蛋白质图谱v25有哪些新内容？
HPA v25包含超过1000万张手动注释的生物图像，以及从30万个生物样本中提取的超过60亿次检测数据，覆盖细胞、组织、器官和血液中的蛋白质编码基因。
在血液方面，HPA v25整合了Olink HT和SomaScan平台在32个疾病队列中的分析数据。总体而言，该资源涵盖了71种疾病，包括癌症、自身免疫病、传染病、神经疾病和心血管疾病，以及追踪儿童期、衰老和怀孕的健康队列数据。
相互作用资源包括超过15,000种蛋白质的网络，以及基于AlphaFold3建模预测的23,000个蛋白质-蛋白质相互作用结构。
在单细胞领域，HPA v25增加了来自34种组织类型的数据，包括肾上腺、垂体、附睾和膀胱尿道，以及使用单核分析更新的主要组织（脂肪、心脏、骨骼肌、肾脏）。单细胞数据集现在覆盖154种细胞类型，代表了大多数人类细胞类型。
组织和亚细胞模块也通过八种新组织得到增强，如脉络丛、输出管、卵巢和胎盘阶段，以及用于多重分析的新胰腺抗体面板和人类诱导多能干细胞中的亚细胞定位数据。
人类蛋白质图谱的意义
通过将蛋白质谱与特定疾病和生命阶段联系起来，扩展版HPA支持转化医学和精准医学研究。蛋白质相互作用网络和单细胞数据的纳入还允许研究人员在结构和细胞水平上研究蛋白质功能。
"HPA团队自豪地发布这一新版开放获取的HPA，其中包含大量内部和外部生成的新数据。特别是，新的人类疾病血液资源应该对所有对转化医学感兴趣并致力于从发现迈向精准医学的研究人员有价值，"HPA联盟主任Mathias Uhlen博士表示。
本文是对人类蛋白质图谱发布的新闻稿的重写。材料已根据长度和内容进行了编辑。
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