研究人员发现,BCR::ABL1数字PCR在临床上的应用可以可靠地量化慢性髓性白血病(CML)的稳定深度分子缓解,这将有助于确定哪些患者可以潜在地停止长期药物治疗。这种独特的CML转录本比目前的标准实时定量PCR(RT-qPCR)更敏感和准确,能够检测到极低水平的残留白血病疾病。研究结果发表在《分子诊断学杂志》上。
首席研究员Peter E. Westerweel博士,荷兰多德雷赫特阿尔伯特·施韦策医院内科部门表示:“在我们的研究中,我们展示了数字PCR在几乎所有(97%)深度分子缓解患者的样本中达到了足够高的灵敏度。在标准RT-qPCR技术无法检测到的患者中,有三分之二的患者通过数字PCR检测到了分子靶标。因此,数字PCR更敏感、更准确,能够可靠地测量以选择适合停药的CML患者。”
BCR::ABL1是一种特定的遗传融合蛋白,是CML的特征,由两个基因BCR和ABL1异常连接而成。通过使用酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)进行靶向治疗,CML患者可能达到深度分子反应。达到这种深度缓解的患者可以拥有正常的预期寿命,并且可能有资格尝试停用TKI。
在全国性的前瞻性多中心研究中,收集了考虑停用TKI的荷兰CML患者的样本。从2020年7月开始,共收到31家医疗机构的136名CML患者的168个样本,直到2023年5月进行分析。
Westerweel博士评论说:“BCR::ABL1数字PCR被发现能够在国际标准的0.0023%水平上准确量化BCR::ABL1,这是无治疗缓解的临床相关预测截断值。目标灵敏度设定为MR5.0,要求在至少10万个常规拷贝的背景下可靠地检测到一个转录本。这一目标在97%的评估中实现。数字PCR能够检测并量化68%低于当前标准RT-qPCR检测限的样本中的BCR::ABL构建体。”
此外,研究人员注意到,在数字PCR技术产生的荧光液滴中,不同患者之间的荧光水平存在差异。这是由于个别患者携带的转录本类型不同。高荧光液滴包含目标转录本类型,被认为是阳性,而低荧光液滴被认为是阴性。
Westerweel博士解释说:“一些患者具有所谓的e13a2转录本类型,而另一些患者具有e14a2转录本类型。我们验证了该测定法可用于识别可检测疾病患者的转录本类型。这一额外发现非常重要,因为我们之前已经表明,转录本类型是药物停用后分子复发的风险因素。通常,一旦患者进入深度缓解,标准技术无法确定转录本类型。”
这项研究中使用的BCR::ABL数字PCR采用了一种FDA批准的商业可用测定法,使其普遍使用成为可能。这项技术可以通过更精确地监测微小残留病灶和更好地评估考虑无治疗缓解的患者的风险来改善CML的管理。
Westerweel博士总结说:“BCR::ABL数字PCR是一种有价值的、可靠的工具,可以帮助CML的临床决策。”
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