我们通常认为人体是个独立的个体，但实际上体内存在数十亿细胞的共生关系。近期研究表明，人体肠道微生物群不仅参与代谢和消化，还可能通过神经通路影响情绪。由比利时鲁汶天主教大学Sarah Viera Silver和Joran Rays领导的研究团队，在分析1054名佛兰德斯肠道菌群计划参与者后发现：产生丁酸盐的普拉梭菌（Faecalibacterium）和考拉杆菌（Coprococcus）与更高生活质量指标相关，而抑郁症患者体内这类菌群显著减少，且与炎症相关菌群（Dialister和Cuprococcus）的丰度变化存在关联。
研究进一步筛选出56种肠道菌群产生的神经功能关键物质，其中丁酸盐作为抗炎分子与抑郁症状呈负相关。值得注意的是，克罗恩病患者的肠道菌群特征与抑郁症患者存在部分重叠。2017年《普通精神病学年鉴》综述指出，尽管益生菌对抑郁症状的改善存在积极证据，但菌株类型、剂量和疗程差异导致研究结果存在异质性。
当前多项临床试验正在探索粪便微生物移植（FMT）对抑郁症的疗效。巴塞尔大学神经科学家Andre Schmidt主导的研究将招募40名中重度抑郁症患者，通过服用冷冻粪菌移植胶囊（俗称"粪菌胶囊"）观察心理健康变化，预计2021年11月完成研究。美国胃肠病学会设立的全球最大粪菌移植国家登记处，则计划追踪4000名接受该治疗者的身心状况达十年之久。
虽然目前尚无法确定菌群变化与抑郁的因果关系，但"菌群-肠-脑轴"理论为精神疾病治疗开辟了新方向。正如研究者指出的：抑郁可能与饮食习惯形成双向影响，未来或许会出现结合益生菌干预和心理治疗的新型诊疗模式。
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