增强子在指导细胞分化和发育所必需的基因表达程序中起着关键作用。3D基因组定位和单细胞分析的最新进展揭示了动态增强子活性和染色质拓扑结构对干细胞命运决定的重大影响。尽管取得这些进展，学界对增强子-启动子通信、相分离过程以及增强子的代谢调控等精确机制的理解仍存在显著空白。利用增强子编辑技术进行再生医学和疾病建模的潜力尚未被充分发掘。本研究专题旨在通过整合前沿基因组学、先进成像技术和计算方法，弥合这些知识鸿沟，探索增强子和3D基因组结构如何影响干细胞行为。通过汇集跨学科研究，目标是深化基础认知，并在干细胞生物学和表观遗传学领域激发治疗创新。
本研究专题旨在解决多个关键科学挑战，例如阐明增强子动态和3D基因组折叠如何调控干细胞可塑性，探究代谢和环境因素如何调节增强子活性以改进细胞重编程，以及理解如何利用增强子工程技术进行疾病建模和再生治疗。为实现这些目标，特别鼓励采用染色质定位的单细胞多组学方法、用于功能验证的CRISPR增强子编辑以及相分离检测等技术的文章。随着增强子枢纽的活体成像和AI增强的增强子预测等最新创新，本专题旨在为推进干细胞调控和基因组架构研究提供路线图。
为深化该领域见解，我们欢迎涉及但不限于以下主题的文章：
- 多能性和分化过程中的增强子-启动子通信
- 增强子簇组装中的相分离现象
- 增强子活性的代谢调控
- 用于治疗应用的CRISPR增强子工程技术
- 非编码变异对干细胞功能障碍的影响
- 发育和疾病中CTCF/粘连蛋白介导的拓扑重塑
- 增强子RNA（eRNAs）作为细胞命运的调控因子
- 增强子语法的进化保守性
- 环境信号与表观遗传记忆
- 增强子靶向疗法的临床转化
关键词： 增强子动态，3D基因组结构，干细胞命运调控，CRISPR增强子工程，表观遗传与代谢调控
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