厄尔汉姆研究所、爱丁堡大学和赫瑞瓦特大学的研究人员分析了肠道细胞，以了解克罗恩病常见并发症——纤维化（影响10%–20%的患者）背后的驱动因素。当肠道炎症区域形成瘢痕组织时，肠腔内的空间变小且更受限，导致肠梗阻症状。目前尚无针对该并发症的药物疗法——随着纤维化加重，手术成为唯一选择。
研究人员发现，瘢痕组织积聚最严重的部位是黏膜下层（肠道内层下方的一层组织）——这表明黏膜下层可能是瘢痕形成的起始点。
论文《克罗恩病淋巴聚集物与内皮细胞簇在纤维狭窄性克罗恩病黏膜下层纤维化中共定位》发表在《病理学杂志》上。
炎症是克罗恩病的标志，它使免疫细胞簇或聚集物进入黏膜下层。研究人员使用单细胞RNA测序研究克罗恩病的纤维化，发现内皮细胞（通常衬于血管内壁的细胞）围绕这些免疫细胞群（称为克罗恩淋巴聚集物）形成不寻常的聚集。这些血管细胞簇直接或通过巨噬细胞向瘢痕形成细胞发出信号，使其开始产生过量胶原或瘢痕组织。这表明克罗恩淋巴聚集物可能在驱动纤维化过程中发挥重要作用。
爱丁堡大学病理学教授兼爱丁堡病理学主任马克·阿伦兹教授说：“病理学家、胃肠病学家、生物医学科学家和计算机专家在爱丁堡大学、赫瑞瓦特大学与厄尔汉姆研究所、桑格研究所的研究人员合作了六年多，研究克罗恩病纤维化过程的细胞和分子机制，以试图确定可用于治疗患者的新治疗靶点，从而减缓或逆转纤维化，帮助此类克罗恩病患者。”
这项研究证明了单细胞转录组学在补充临床样本组织学分析方面的价值。通过将组织病理学与细胞和信号机制联系起来，我们可以更清晰地了解通常难以在形态学上分离的疾病相关细胞亚群。
该论文来自一个国际合作研究团队，他们正在创建“肠道细胞图谱”——一种识别和表征肠道细胞的研究工具——从而能够更深入地了解并更快地解决影响消化系统的疾病。
在厄尔汉姆研究所，帕帕西奥多罗研究组的科学家们将他们在单细胞基因组学方面的计算专业知识与尖端数据科学和人工智能相结合，开发出整合数据、标准化元数据、构建细胞图谱以及分析跨物种图谱所需的工具和方法。
厄尔汉姆研究所帕帕西奥多罗研究组的博士后研究员、共同第一作者格雷戈里·威克姆博士说：“纤维狭窄仍然是克罗恩病中一个显著且未得到解决的发病原因，这项工作为理解其进展做出了重要贡献。这项合作使我们能够将详细病理分析与单细胞RNA测序相结合，以表征淋巴聚集物如何随纤维化积累，并揭示细胞如何协调其行为以驱动这一过程。这些见解将支持我们继续研究克罗恩病，旨在确定新疗法的候选靶点，以更好地管理纤维狭窄并发症。”
厄尔汉姆研究所数据科学负责人艾琳·帕帕西奥多罗教授说：“单细胞转录组学与计算分析相结合的力量在于，它能够揭示在其他情况下无法辨别的细胞相互作用。通过将我们的计算框架与临床病理学相结合，我们已经能够绘制出黏膜下层内炎症转变为永久性瘢痕的特异性细胞邻域。这项研究为理解克罗恩病进展轨迹铺平了道路，未来有望确定干扰纤维化分子机制的新靶点。”
需要进一步分析来确认这些相互作用，因此这项研究的下一步将涉及使用相同方法增加分析的肠道样本数量。这项研究对于发现新的治疗靶点至关重要，以便为数十万遭受这种痛苦并发症、严重影响生活质量的克罗恩病患者找到更好的治疗方法。
爱丁堡大学遗传学与癌症研究所博士后研究员、共同第一作者迈克尔·格林卡博士说：“理解导致克罗恩病晚期纤维狭窄病变的驱动因素的根本必要性促成了爱丁堡大学、赫瑞瓦特大学、桑格研究所和厄尔汉姆研究所之间的这项合作与工作。没有适当的表征和理解，就无法开发新方法和新疗法，因此我们希望借助这项工作及后续研究，能够帮助未来开发更好的治疗方法。”
详细信息：迈克尔·格林卡等，克罗恩病淋巴聚集物与内皮细胞簇在纤维狭窄性克罗恩病黏膜下层纤维化中共定位，《病理学杂志》（2026）。DOI: 10.1002/path.70019
期刊信息：《病理学杂志》
关键医学概念：克罗恩病、纤维化、肌成纤维细胞
临床分类：胃肠病学
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