结果显示，影响取决于药物的类型。
抗生素治疗可以长期改变肠道微生物群——即肠道内细菌群落的组成。发表在《自然·医学》杂志上的一项新研究表明，某些抗生素在治疗后四到八年仍能影响微生物群。
抗生素对于严重感染很重要；然而，研究将其频繁使用与某些疾病（如2型糖尿病和胃肠道感染）风险增加联系起来。科学家认为，肠道微生物群的变化可能在其中发挥作用。虽然抗生素的短期影响众所周知，但这些变化的持续时间至今尚未得到充分研究。由乌普萨拉大学科学家领导的国际研究团队研究了抗生素使用与肠道微生物群组成之间的关系。为此，他们分析了近15000名瑞典成年居民的用药数据和微生物群样本。
结果显示，影响取决于抗生素的类型。使用克林霉素、氟喹诺酮类和氟氯西林后观察到了最显著的变化。同时，常用于社区获得性感染的青霉素V仅引起轻微且短暂的变化。作者指出，该研究仅考虑了最近八年的处方，并且参与者的微生物群样本仅采集了一次，因此更长时间的观察可能会提供更准确的结果。
肠道的主要负面后果
菌群失调：有益微生物群的组成遭到破坏、多样性减少，使病原微生物占据腾出的空间。
抗生素相关性腹泻：由于肠道功能受损，发生在5%–39%的患者（包括儿童和成人）中。
局部免疫力下降：黏膜防御减弱，免疫球蛋白A产生减少。
炎症过程：严重情况下可能发生伪膜性肠炎和肠道念珠菌病。
耐药性风险：反复使用抗生素会促进细菌对药物产生耐药性。
为了最大限度地减少伤害，务必在医生指导下使用抗生素，必要时服用益生菌以支持微生物群。
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