研究概述
本研究描述了一种新建立的患者来源皮肤黑色素瘤(CM)初级细胞系MelT79,该细胞系源自一位初始诊断为IB期CM患者转移病灶。通过多色荧光原位杂交(M-FISH)、高分辨率比较基因组杂交(HR-CGH)和靶向下一代测序技术,研究团队发现MelT79细胞系具有复杂的核型特征,包括CDKN2A/B、SPRED1和B2M等关键基因缺失,同时携带BRAF V600E突变和此前未在CM中报道的RET S649L突变。
临床背景
该患者于2009年确诊右大腿皮肤黑色素瘤(厚度2mm),接受手术切除后维持疾病缓解4年,但2013年起出现皮肤和淋巴结转移,2015年检测到BRAF V600E突变后开始BRAF/MEK抑制剂治疗。至2023年已发生肾上腺、腹壁及多区域转移,先后接受PD-1抑制剂和CTLA-4联合治疗。
建立方法
研究团队在2023年手术切除的腹膜后转移灶中成功建立细胞系。采用机械消化法(避免酶解损伤)结合McCoy's 5A培养基(低酪氨酸浓度),在排除成纤维细胞干扰情况下成功培养。通过定期支原体检测确保培养体系纯净。
基因组特征
M-FISH分析显示MelT79存在从近二倍体(n=8)到近五倍体(n=6)的染色体数目变异,伴有大量非聚集性结构异常(包括染色体内倒位和跨染色体重排)。HR-CGH检测确认9p21(CDKN2A/B)、15q14(SPRED1)和15q21.1(B2M)等位点缺失,这些改变与同源重组修复缺陷相关。
分子特征
NGS检测显示:
- BRAF V600E突变:与患者2015年转移灶一致
- RET S649L突变:在早期转移灶中即存在,提示为肿瘤进展早期事件
- 其他变异(SDHA、PIK3CA等):仅在FFPE样本中检出,可能为亚克隆事件
值得注意的是,该RET突变在甲状腺髓样癌中已有报道,但在CM中属首次发现,其对靶向治疗和免疫治疗反应的影响有待深入研究。
表型特征
分化标志物
- MITF表达水平:介于G-361和A375之间
- TYRP1高表达:与MITF调控关系一致
- 存在显著的细胞间异质性:MITF表达范围差异达4倍
增殖能力
- 倍增时间:49小时(显著慢于A375等商业化细胞系)
- BrdU掺入率:与分化型MNT-1相当,但低于侵袭型WM115
药物敏感性
- 对BRAF/MEK抑制剂呈中等抗性:
- IC50高于MNT-1
- 低于WM115
- 这种中间表型反映其表型可塑性
重要发现
- RET S649L的治疗意义:该突变持续存在于多个转移灶,可能提供新的靶向治疗机会
- 基因组不稳定性机制:CDKN2A/B缺失导致中心体过度复制,与观察到的染色体异常相关
- 免疫治疗抵抗:B2M缺失可能影响MHC-I抗原呈递,解释PD-1抑制剂疗效不佳
- 表型动态平衡:同时表达分化(TYRP1)和侵袭标志物(MMP3),揭示黑色素瘤进展的复杂性
研究价值
MelT79细胞系为研究CM异质性、治疗抵抗机制(包括RET突变功能)提供了独特模型。其表型可塑性特征(分化与侵袭状态共存)和基因组不稳定性特征,为开发针对肿瘤进化动态的治疗策略提供了实验基础。未来研究需重点探索:
- RET抑制剂在该模型中的疗效
- 基因组不稳定性与表型可塑性的分子关联
- 免疫检查点疗法反应的预测标志物
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