摘要
目标 肠道微生物组构成与多种疾病相关，但其与长期结局指标的关系研究较少。尽管肠道菌群失调已与普通人群死亡风险相关联，其在特定疾病患者中与总体生存率的关系尚未深入探讨。本研究通过深入分析实体器官移植受者（SOTR）肠道菌群失调与全因及特定原因死亡率的关联，提供重要实证。
设计 我们分析了来自TransplantLines生物样本库及队列研究的1337份粪便样本宏基因组数据，涵盖766名肾移植、334名肝移植、170名肺移植及67名心移植受者，该前瞻性队列研究包含6.5年随访的详细表型数据。为评估肠道菌群失调，我们额外纳入了同地区（荷兰北部）8208例普通人群的宏基因组数据。通过多变量Cox回归和机器学习算法，分析包括单菌种丰度在内的多种菌群失调指标与全因及特定原因死亡率的关联。
结果 我们识别出两种表征整体菌群群落变异的模式，均与全因及特定原因死亡率相关。每位移植受者与普通人群平均菌群的差异距离与全因死亡率及感染、恶性肿瘤和心血管疾病导致的死亡相关。多变量Cox回归分析发现23种细菌菌种与全因死亡率显著关联；通过机器学习算法，进一步筛选出其中19种菌种构成的平衡比值（一种对数比率），该比值模型与全因死亡率存在明确关联。
结论 肠道菌群失调在实体器官移植受者中持续与死亡率相关，支持菌群失调影响长期生存的现有观察。鉴于本研究数据无法推断因果关系，需开展更多临床前研究以阐明作用机制，方能确定是否可设计肠道微生物组靶向疗法以改善长期预后。
- 肠道微生物学
- 肝脏移植
数据可用性声明
数据可根据合理请求获取。本研究使用的原始微生物组测序数据及基础表型数据已存入欧洲基因组-表型组档案库，登录号为EGAD00001008907、EGAS00001006257和EGAS00001006258。出于患者隐私保护，与宏基因组数据集关联的临床数据集需向格罗宁根大学医学中心申请获取。数据访问需通过电子邮件（datarequest.transplantlines@umcg.nl）提交数据访问申请表，审核将在两个工作周内完成。该流程旨在确保数据仅用于科研目的，符合TransplantLines参与者签署的知情同意书要求，明确禁止数据用于商业用途。
脚注
- 贡献者 HB、JCS、SJLB、RKW和JRB构思并设计研究项目；JCS、SJLB和RKW获取研究资助；TJK、JCS、HB、EAMV、TCG和SJLB负责样本采集；JCS和JRB进行数据分析与解读；JCS、JRB、SJLB和RKW起草论文；JCS、RG、RKW和JRB修订论文；SZ、LMN、RG、TJK、VEDM、KD、EAMV、TCG、JF、AZ、HJMH和HB参与论文关键审阅；JCS、SJLB、JRB和RKW对研究工作负全责。全体作者批准论文最终版本。
- 资金支持 本研究获荷兰经济事务与气候政策部、Seerave基金会、Chiesi Farmaceutici（项目号PA-SP/PRJ-2020-9136）、Astellas BV、荷兰研究理事会（NWO/TTW/DSM项目号14939）及欧盟地平线欧洲计划（miGut-Health 101095470）资助。
- 利益冲突声明 TransplantLines生物样本库研究获Astellas BV和Chiesi Pharmaceuticals BV资助；RKW获Seerave基金会、荷兰研究理事会及欧盟地平线欧洲计划（miGut-Health项目）支持；JF获荷兰心脏基金会、欧洲研究理事会、荷兰研究理事会及荷兰器官芯片计划资助。
- 患者及公众参与 本研究设计、实施、报告及传播计划均未涉及患者或公众参与。
- 研究来源与同行评审 非约稿；经外部同行评审。
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