对于科学事业而言，2025年充满了挫折与挑战。但科学家们对逆境并不陌生——克服障碍的能力是我们训练中固有的一部分。因此，全国各地的研究实验室找到了继续推进科学发现的方法。结果，2025年涌现了本十年最具影响力的科学新闻。在本特辑中，GEN编辑回顾2025年，重点介绍六大年度重要新闻——这些时刻不仅重塑了相关领域，也展示了推动科学研究的韧性和决心。
FDA与Sarepta就Elevidys死亡事件的应对措施产生分歧
作者：亚历克斯·菲利皮迪斯
今年，三名接受Sarepta Therapeutics公司上市治疗药物Elevidys®（delandistrogene moxeparvovec-rokl）的杜氏肌营养不良症（DMD）患者死亡，以及美国食品药品监督管理局（FDA）的突然反应，重新引发了关于基因治疗安全性的长期讨论。
3月份，一名16岁男性在接受Elevidys治疗后死于急性肝衰竭，Elevidys是唯一获得FDA批准用于DMD治疗的基因疗法。三个月后，第二名年龄未公开的Elevidys患者死亡。由于这两名患者均为非行走型患者，Sarepta停止向非行走型患者运送Elevidys，并暂停了III期ENVISION试验（NCT05881408）。
在第三名8岁巴西男孩死亡后，FDA要求Sarepta暂停向行走型患者运送Elevidys。Sarepta最初拒绝，后于7月21日同意。几天后，在巴西当局排除基因治疗是导致该男孩死亡的因素后，FDA改变了立场，建议Sarepta恢复向行走型患者运送Elevidys。
这场对峙反映了FDA生物制品评价与研究中心主任Vinay Prasad博士在监管药物和审批申请方面采取了更为保守的方法。据新闻报道，在保守派领导人和DMD患者倡导者向国会、FDA和特朗普总统提出请求后，FDA改变了对Sarepta的立场，这些倡导者发起了Change.org请愿活动。Prasad于7月29日辞职，但于8月9日重返FDA岗位。
FDA的数据库还显示另有两名Elevidys患者死亡。Sarepta表示这些死亡与基因治疗的使用无关。
Baby KJ展示个性化医疗的曙光
作者：萨凡纳·威格尔
2025年5月，世界认识了"Baby KJ"，首位接受完全个性化体内CRISPR治疗的患者——这项N-of-1疗法由费城儿童医院（Children's Hospital of Philadelphia）的一个团队领导。该团队与学术界、产业界和政府合作伙伴合作，开发了一种针对KJ的氨甲酰磷酸合成酶I（CPS1）基因独特突变的定制mRNA为基础的CRISPR疗法。
KJ Muldoon于2024年8月在费城儿童医院出生，在使用CRISPR技术治疗罕见遗传疾病后向医生伸出手。[Chloe Dawson/费城儿童医院] "我们需要以患者为先的方法，无论患者身在何处，面对任何变异。每一位患者都应有机会获得这种治疗，"今年5月在美国基因与细胞治疗学会（ASGCT）会议上，宾夕法尼亚大学Perelman医学院转化研究教授Kiran Musunuru博士宣布。
这一成就需要在紧张的时间表下进行协调冲刺。IDT、Aldevron、Danaher、Acuitas Therapeutics等公司的团队共同努力，提供了基因编辑有效载荷及其递送系统，标志着CRISPR疗法领域的前所未有的合作。Baby KJ的案例不仅成为个性化基因组编辑未来的蓝图，也凸显了一个关键瓶颈：可扩展性。将个性化疗法提供给超过少数患者的群体将需要模块化、自动化的生物处理平台、数字文档管道和能够处理单个微批次的灵活监管途径。
这一时刻呼吁我们重新思考医学如何满足个体需求。为应对这一挑战，新的联盟正在形成。创新基因组学研究所（Innovative Genomics Institute）和陈-扎克伯格倡议（Chan Zuckerberg Initiative）启动了儿科CRISPR治疗中心，产业合作伙伴正在投资下一代制造中心。加州大学伯克利分校（UC Berkeley）分子治疗学教授、创新基因组学研究所技术与转化总监Fyodor Urnov博士指出："正在有大量创新即将到来……以帮助下一个Baby KJ。"
Boltz-2与药物发现的开源未来
作者：费伊·林博士
6月，麻省理工学院（MIT）健康机器学习Jameel诊所的研究人员与AI生物技术公司Recursion合作，宣布开源发布Boltz-2，该模型现在能够以新的速度和准确性预测分子结合亲和力，帮助"民主化"商业药物发现。该模型在MIT的高许可性许可下提供，允许商业使用。
小分子与OX2蛋白结合。[Recursion] 结合亲和力是衡量药物与其靶标之间相互作用强度的实验指标，是药物发现的关键指标，可以决定候选药物在早期药物发现和开发管道中的进展。鉴于此类实验每个分子可能花费数百至数千美元，应用Boltz-2可以减少推进药物候选物所需的时间和实验轮次，从而节省成本。
在准确性方面，Boltz-2在2024年12月的蛋白质结构预测16（CASP16）竞赛中表现最佳，该竞赛每两年评估结构生物学领域的最新尖端模型。在速度方面，据报道，Boltz-2只需20秒即可计算结合亲和力值，比当前基于物理的计算标准——自由能扰动（FEP）模拟快1000倍。
"就在看似AlphaFold3等闭源模型将主导该领域的时候，许多来自学术界和工业界的研究人员决定为Boltz等开源项目做出贡献，构建新能力并向所有人开放使用，"MIT的Boltz开发者之一Gabriele Corso博士说。
细胞和基因治疗的过山车之旅
作者：凯文·戴维斯博士
在Intellia于10月份自愿暂停其临床试验之前，很少有生物技术评论员熟悉Hy's Law，原因是80岁的试验志愿者因严重的肝酶升高而住院。当行业匆忙理解这一不良事件的病理发生时，Intellia的投资者纷纷撤离，而FDA发布了临床暂停令。此后，该患者死亡。
就在一个月前，该领域还在庆祝UniQure发布的显著临床数据。伦敦的研究人员报告了针对无法治愈的成人发作型亨廷顿病患者的基因治疗试验的初步结果，其中直接精确注射到患者大脑的RNA构建体停止了症状，甚至在某些情况下逆转了症状。但FDA在11月通过改变终点目标门槛打消了这种热情；UniQure的股价在消息公布后暴跌60%。
今年早些时候，在"Baby KJ"故事之后，FDA总部举办了一场特别的圆桌讨论会，讨论了细胞和基因治疗的潜力。David Liu博士告诉FDA领导层，该社区可以使用定制基因编辑器治疗多达1000名罕见遗传疾病儿童。随后，FDA在获得FDA国家优先权券的九个项目中仅包括了一种基因疗法（用于遗传性耳聋）。
首款基于CRISPR的药物的采用正在稳步加快：Vertex最近披露，约有165名镰状细胞病或地中海贫血患者已采集干细胞，准备接受Casgevy治疗，而39人已接受治疗。细胞和基因治疗仍然是一个令人兴奋的领域，展示了创新科学和递送系统，但获得批准的道路仍然困难。
NIH预算削减如何威胁美国科学
作者：乌杜阿克·托马斯
今年最具后果性的决定之一可能是美国政府决定大幅削减国家卫生研究院（NIH）支持的科学研究资金。根据麻省理工学院（MIT）和约翰霍普金斯大学（JHU）牵头的一项研究估计，本届政府削减了超过40%的NIH研究资金，并为2026财年提出了包括额外削减机构预算39%的预算提案。
考虑到NIH资助的研究在过去几十年中对数百种获批药物和疫苗的发现做出了贡献，这是一个令人担忧的转变。作为这种决策可能产生影响的例子，MIT和JHU的同一项研究发现，"自2000年以来FDA批准的药物中超过一半与NIH研究有关，在40%的预算削减下可能会被削减。"
现任政府上台不到一年，资金削减已经对大学、研究中心和核心实验室造成压力，博士项目取消学生录取并搁置计划中的研究和试验。全国各地的科学家一直在呼吁政府保护生物医学研究的未来，从"为科学站出来"游行开始，以及由1200多名科学家签署的信件，要求NIH主任Jay Bhattacharya博士恢复被削减的研究拨款。但如果没有具体行动，这些削减可能会减缓关键药物、疗法和疫苗的开发，而这些药物、疗法和疫苗可能在现在和未来拯救生命。
通过原核转移技术诞生的八名健康婴儿为线粒体疾病带来希望
作者：朱莉安娜·勒米厄博士
今年夏天带来了一项突破，为受线粒体疾病影响的家庭带来了新的希望。八名婴儿——出生自有高风险传递由线粒体基因组突变引起严重疾病的女性——得益于原核转移技术，没有表现出线粒体疾病的迹象。这八名婴儿年龄从0个月到24个月以上不等，在出生时均被认为健康，且发育正常。
从携带线粒体DNA突变的卵子中"移除"核DNA。[Newcastle Fertility Centre, Newcastle Hospitals NHS Foundation Trust] 原核转移技术于2010年首次描述，涉及将携带线粒体DNA突变的卵子中的细胞核移植到一名未受影响女性捐赠的、已移除核基因组的卵子中。由此产生的胚胎继承了父母的核DNA，但线粒体DNA主要来自捐赠的卵子。
在该试验的随访中，所有婴儿都达到了相应的发育里程碑。作者表示，儿童的任何其他健康状况都不认为与母体线粒体DNA突变有关。
团队对这些结果有何感受？"这很令人放心。绝对的，"纽卡斯尔大学（Newcastle University）NHS罕见线粒体疾病高度专业服务主任、儿科线粒体医学教授Bobby McFarland博士表示。过去，为患有线粒体疾病的人提供建议一直很困难。但他指出，现在出现了一幅画面，提供了足够的信息，使人们能够做出明智的决定。随着这些数据而来的是谨慎的乐观。"看到这些婴儿，知道他们不会患上线粒体疾病，真是太棒了，"他说。
参考文献
- NIH资金削减对药物发现和开发的影响。
- 纽约市科学家集会捍卫并支持科学。
- 科学家敦促NIH主任恢复被特朗普政府暂停的研究拨款。
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