摘要
背景
乳糜泻影响约1-2%的人口，目前仍无法治愈，需要终身进行饮食限制。人们认为肠道微生物组可能参与了乳糜泻的发展和进展。然而，以往研究的结果分散不一，难以确切理解肠道微生物组是如何参与其中的。
方法
我们整合了来自全球数据集的900多个样本，涵盖不同的疾病阶段（发病前、活动期和治疗后）、身体部位和研究方法。使用16S rRNA基因测序和鸟枪法宏基因组学分析肠道微生物组。Alpha和beta多样性分析以及差异丰度测试确定了与乳糜泻相关的细菌群落的一致变化。机器学习测试了微生物组数据预测疾病状态的能力。
结果
本研究显示，乳糜泻并不以肠道微生物组多样性发生大幅变化为特征。相反，特定细菌存在微妙但一致的变化，包括有益的丁酸生产菌（Faecalibacterium、Prevotella、Agathobacter、Gemmiger），粘蛋白相关微生物（Akkermansia muciniphila）发生变化，以及潜在有害细菌（Helicobacter、Campylobacter、Haemophilus parainfluenzae）增加。这些变化在疾病发生前和活动期都存在，并在无麸质饮食后持续存在。基于微生物组的疾病预测对活动期疾病具有中等准确性，但前瞻性预测能力较弱，可能受训练数据限制。
结论
我们的发现表明，乳糜泻与肠道细菌的特定变化相关，而这些变化不能仅通过饮食完全解决。未来的治疗方法可能需要专注于恢复健康的肠道细菌，而不仅仅是避免麸质，以更好地管理这种疾病。
简明语言摘要
乳糜泻影响全球1-2%的人口，患病率正在增加，许多病例仍未被诊断，且需要严格的无麸质饮食。研究人员认为肠道中的细菌可能起到一定作用，但过去的结果不一致。在本研究中，我们分析了来自全球900多个样本的数据，以识别与乳糜泻相关的肠道微生物组模式。研究发现，在患病人群中，某些有益细菌较少，而一些有害细菌较多，这些变化甚至在遵循无麸质饮食后仍然存在。这表明仅仅避免麸质可能不够，未来的治疗方法还应关注恢复健康的肠道细菌。
致谢
感谢新西兰健康研究委员会为本工作提供资金支持。A.S. Day的研究由Cure Kids资助。Prendergast, P.J.得到了ISCCD导师计划的支持。本研究由新西兰健康研究委员会资助，项目编号22/572。资助方对研究设计、数据收集与分析、发表决定或手稿准备没有任何作用。原始数据集的资金来源见各自出版物。
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