摘要
理解肠道微生物如何转化药物及其对微生物组组成和功能的影响，是更好地理解药物疗效和副作用的关键问题。为加速发现微生物组衍生的药物代谢物，研究团队开发了一个功能性代谢组学工作流程，该流程结合了合成微生物群落（SynComs）的使用、时间序列分子网络分析方法以及先进的计算代谢物注释技术。本研究展示了如何利用该框架阐明50种临床药物在肠道合成微生物群落（Com20）中的化学转化动态。结果突显了多种药物代谢物，包括多步代谢级联反应，其中一些与微生物分类群的变化相关，表明微生物组组成与生化转化之间存在功能联系。研究团队的计算数据分析工作流程已通过GNPS2生态系统公开提供，可用于在各种生物和非生物系统中优先处理生物转化和其他（生化）化学反应。
竞争利益声明
王明轩（Mingxun Wang）是Ometa实验室有限公司（Ometa Labs LLC）的联合创始人。
基金信息声明
美国国家普通医学科学研究所（National Institute of General Medical Sciences），项目编号GM160154
美国国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所（National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases），项目编号5U24DK133658-02
德国研究基金会（Deutsche Forschungsgemeinschaft），项目编号EXC 2124, MA 8164/1-1
欧洲研究理事会（European Research Council），项目编号gutMAP 101076967
欧盟（European Union），项目编号101108450 MeStaLeM
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