大多数已知类型的DNA损伤通常由细胞自身的DNA修复机制修复,但新研究表明,某些形式的DNA损伤可以逃避修复并持续多年。这意味着这些损伤有多个机会生成有害突变,进而可能导致癌症。
来自惠康桑格研究所(Wellcome Sanger Institute)及其合作者的科学家们分析了数百个单细胞的家谱树,这些单细胞来自几位个体。研究团队通过细胞之间共享的突变模式构建了这些家谱树,表明它们有共同的祖先。
研究人员在家谱树中发现了意外的突变遗传模式,揭示了一些DNA损伤未被修复而长期存在。特别是在血液干细胞中,这种损伤可以持续两到三年。
这项研究于1月15日发表在《自然》杂志上,改变了我们对突变的看法,并对理解各种癌症的发展具有重要意义。
在我们的一生中,体内所有细胞的基因组都会积累称为体细胞突变的遗传错误。这些突变可能是由于环境暴露(如吸烟)或细胞内的日常化学反应引起的。
DNA损伤不同于突变。突变是指四个标准的DNA碱基(A、G、T或C)之一出现在错误的位置,类似于拼写错误;而DNA损伤则是DNA的化学改变,就像一个模糊的、无法辨认的字母。
DNA损伤可能会导致在细胞分裂期间的DNA复制过程中,基因序列被错误读取和复制,从而引入永久性的突变,这些突变可能促进癌症的发展。然而,DNA损伤本身通常会被细胞的修复机制迅速识别和修复。
如果研究人员能更好地了解突变的原因和机制,他们或许能够干预并减缓或消除这些突变。
在一项新研究中,桑格研究所的科学家及其合作者分析了数百个单细胞的家谱树数据。这些家谱树是基于基因组中细胞间共享的突变模式构建的,例如,具有许多共享突变的细胞有一个最近的共同祖先细胞,因此关系密切。
研究人员整理了七个已发表的家谱树数据集,即体细胞系统发育树。该数据集包括来自89位个体的103个系统发育树,涵盖了血液干细胞、支气管上皮细胞和肝细胞。
研究团队在家谱树中发现了意外的突变遗传模式,揭示了一些DNA损伤可以通过多轮细胞分裂而不被修复。这在血液干细胞中尤为明显,约15%至20%的突变是由一种特定类型的DNA损伤引起的,这种损伤平均持续两到三年,在某些情况下更长。
这意味着在细胞分裂过程中,每次尝试复制受损DNA时都可能犯不同的错误,从而从单一的DNA损伤源产生多种不同的突变。
重要的是,这为有害突变创造了多次机会,可能有助于癌症的发展。研究人员指出,尽管这些类型的DNA损伤发生率较低,但它们的持久性意味着它们可以引起与更常见DNA损伤一样多的突变。
总体而言,这些发现改变了研究人员对突变的看法,并对癌症发展具有重要意义。
惠康桑格研究所和巴茨癌症研究所的第一作者迈克尔·斯宾塞·查普曼博士(Dr. Michael Spencer Chapman)表示:“通过这些家谱树,我们可以追溯数百个细胞之间的关系,直到受精卵阶段,这意味着我们可以追踪每个细胞经历的分裂过程。”
“这些大规模、新颖的数据集使我们发现了这一意想不到的结果,即某些形式的DNA损伤可以在未经修复的情况下长期存在。这项研究是一个典型的探索性科学——你不知道你会发现什么,直到你去探究;你必须保持好奇心。”
惠康桑格研究所、惠康-MRC剑桥干细胞研究所和剑桥大学的作者艾米丽·米切尔(Emily Mitchell)表示:“在特别探索血液干细胞的家谱树时,我们发现了一种特定类型的DNA损伤,它导致了这些细胞中大约15%至20%的突变,并可以持续数年。”
“尚不清楚为什么这个过程只在血液干细胞中出现,而在其他健康组织中没有。知道DNA损伤是长期存在的,为我们提供了新的途径来调查这种损伤究竟是什么。随着我们对突变原因的更好理解,我们有一天可能能够干预并消除它们。”
惠康桑格研究所的首席作者彼得·坎贝尔博士(Dr. Peter Campbell),现为Quotient Therapeutics的首席科学官,表示:“我们已经确定了一些形式的DNA损伤,它们成功逃脱了我们的DNA修复机制,并在基因组中持续存在几天、几个月,甚至有时几年。”
“这些发现不符合科学家之前关于突变是如何获得的基本认识。这一范式的转变带来了新的思考维度,对研究社区在设计未来研究时非常重要。”
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