本文综述了什么？
本综述回顾了细菌基因毒素科利巴克汀（colibactin）及其编码生物合成的pks基因岛，重点阐述了pks阳性细菌在人体中的分布情况、科利巴克汀如何从"前药"转化为活性基因毒素，以及暴露后引发的宿主效应。作者将科利巴克汀定义为一种与微生物群密切相关的毒素，它能触发DNA双链断裂、染色体不稳定性和细胞周期阻滞，并将这些细胞层面的损伤与下游临床意义（如癌症发生和侵入性感染）建立明确关联。
研究涉及哪些人群和模型？
作为一篇综述，本研究整合了多个人群队列和实验模型的证据，而非局限于单一研究群体。综述总结了人类携带状况的研究数据：粪便样本中pks阳性大肠杆菌（E. coli）的检出率约为12–32%，在新生儿群体中（瑞典队列约33%，法国队列26.9%）；同时纳入了尿脓毒症、前列腺炎、新生儿脑膜炎及血培养的临床分离株研究证据。此外，综述还记录了pks基因岛在其他肠杆菌科细菌（如肺炎克雷伯菌）中的分布情况，并引用了动物和细胞模型数据，证实pks阳性细菌可导致上皮细胞DNA损伤和肿瘤表型。
最重要的发现是什么？
对于微生物组特征数据库而言，核心"特征"体现为功能性指标：即由pks阳性肠杆菌科细菌（尤其是常共携带其他毒力因子的B2系统发育群大肠杆菌）引发的定植或感染。综述强调，产生科利巴克汀的细菌会驱动DNA损伤，进而导致上皮细胞衰老和免疫细胞凋亡；这种损伤机制与一个明确的成熟途径紧密关联——ClbM蛋白将前科利巴克汀转运至周质空间，ClbP酶切割前药侧链生成活性毒素，而ClbS则通过环丙烷水解酶功能使基因毒性失活以保护细菌自身。在结构层面，作者重点指出与基因毒性直接相关的分子基序：环丙烷"弹头"结构以及与DNA相互作用的噻唑/双噻唑特征；同时提供了实验证据，表明pks阳性大肠杆菌可诱导DNA链间交联，最终引发双链断裂。
本研究/综述的最大意义是什么？
临床上，本综述支持将pks阳性视为具有临床价值的微生物风险标志物，因为它将特定细菌基因岛与明确病理机制（即伴随细胞衰老/凋亡的DNA损伤）及关键疾病场景（包括结直肠癌和严重侵入性感染）建立了因果联系。研究还提出一项可操作的治疗策略：靶向科利巴克汀生物合成途径的"Clb"抑制剂已展现预防有害效应的概念验证潜力，使毒素通路阻断成为避免广泛破坏微生物组的优选方案。但作者同时警示临床医生需考虑背景因素，因为pks基因岛也具有抗炎、镇痛和抗生素活性等有益功能，因此精准干预策略应聚焦于降低基因毒性输出，而非全盘消除该基因岛的有益作用。
科利巴克汀（Colibactin）
科利巴克汀是由携带pks（clb）生物合成基因簇的部分肠道相关细菌产生的微生物组衍生基因毒素。不同于传统急性毒素，其临床相关性在于能够化学性损伤宿主DNA，造成难以修复的损伤；若细胞存活，可能遗留持久性突变。在微生物组系统框架下，科利巴克汀应被理解为特定细菌代谢的功能性产物，它能与宿主基因组稳定性相互作用，尤其在肠上皮界面区域表现显著。
大肠杆菌（Escherichia coli, E. coli）
大肠杆菌是一种功能多样的细菌，既能作为肠道共生菌发挥生理作用，亦可转变为致病菌，与子宫内膜异位症等慢性疾病存在明确关联。
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